1998年——研究所籌備，開始向山東省科技廳陸續申報相關資料和研發成果。2000年4月——獲山東省科技廳和山東省科學技術委員會批準成立。該所隸屬山東省人文自然保護與開發促進會，為集體制藥物研究機構，主要從事形態藥物的基礎藥學研究。研究所成立后，在人文促進會的大力支持下，省財政廳和省有關部門先后為研究所提供了資金及其它輔助支持，幫助研究所開展基礎藥學研究工作。2001年——開始編寫《形態藥物學研究》。2005年——開始研究植物形態分類和植物圖形學。2006年——在形態藥物學研究的基礎上，開始編寫《藥用植物分類》。2013年——與中國科學院聲學研究所和山東大學機械學院合作，研發了一種生物換能技術并報批了國家發明專利，主要用于不同植物的協同提取工作。2014年——完成了上千萬字的工具書《藥用植物分類》。由此書的誕生，為植物的提取提供了基礎。2015年5月——發現了藥物的作用原理：即生物力的交互作用，創立了“生物交互力學”。?2016年——隨著人文促進會機構改革，山東省形態藥物研究所完成改制。?2016年——在濟陽建立了用于生產藥食同源食品的功能食品廠。2016年——開始構建健康交互系統。2017年10月——與漱玉平民大藥房連鎖股份有限公司簽訂《戰略合作框架協議》。隨后成立山東漱玉換能技術有限公司。2018年——在濟陽的食品廠遷至濟南高新區藥谷產業園。20年來，研究所先后五波次聘請了近百人的研發團隊，投入近3000萬元。從發現植物形態與人體病癥的對應關系著手，開始了漫長全面的基礎藥物研究，終于把對藥物的認識達到了生物交互的程度。這一藥物基本作用原理的發現，將在根本上改變我們對藥物的已有認識。