合肥微尺度物質科學國家實驗室是科技部2003年11月批準籌建的五個國家實驗室之一。實驗室“建設計劃任務書”于2004年11月通過了科技部組織的海內外的論證。　合肥微尺度物質科學國家實驗室是在長期堅持學科交叉與融合的基礎上，通過對相關重點實驗室資源的優化整合，逐步形成的一個以多學科綜合為特點、以國家重大戰略需求和交叉前沿領域為導向的新型實驗室，其學科領域涉及物理、化學、材料、生物和信息，實現了五大一級學科之間大跨度的整合。　　實驗室現設有7個研究部和1個公共技術部。凝聚了一支以具備多學科背景的杰出人才為學科帶頭人、以青年人才為主體的研究隊伍和一支高水平的技術支撐隊伍。110余位研究人員中，包括9位院士，12名“長江學者”特聘教授，32位國家杰出青年獲得者，51位百人計劃入選者，7個國家自然科學基金委創新研究群體和6個教育部創新團隊。 公共技術部是實驗室的技術支持體系，為多學科交叉提供支撐，為加強技術體系的共建、共享，鼓勵技術人員開展實驗技術與實驗方法的創新和先進儀器設備的研制提供了條件，為取得更多原創性科研成果提供必要的技術保障。公共技術部現有理化分析實驗室、生物技術實驗室、低溫強磁場實驗室和正在籌建的微納加工實驗室。公共技術部的建立，實現了裝備資源的合理配置和使用，大型公共儀器設備統一規劃、集中購置和管理，并對國內外開放。