北京大學環境工程實驗室于2008年經北京大學校長授權批準成立，是北京大學唯一專業從事環境分析測試的機構。實驗室于2008年通過國家認證認可監督委員會的計量認證（CMA），成為具有對外出具公證數據資質的環境分析檢測專業實驗室，檢測范圍包括水和廢水、固體物質、空氣和廢棄、噪聲以及特殊污染物項目六大類。 環境工程實驗室目前擁有一批國際先進的分析儀器和設備，包括液相色譜-質譜聯用儀、電感耦合等離子體質譜儀、電感耦合等離子體發射儀、液相色譜儀、氣相色譜-質譜聯用儀、氣相色譜儀、離子色譜儀、總有機碳/無機碳分析儀、原子熒光光譜儀、熒光顯微鏡等30多臺大型儀器設備，可以進行各種環境樣品無機和有機組分的分析檢測。