紫光軟件系統有限公司是清華紫光股份有限公司控股的專業從事軟件與系統集成業務的公司，承接清華紫光股份有限公司在軟件與系統集成領域的全部資產和業務。整個公司以清華紫光應用管理中心、軟件與集成業務為主的事業部和清華紫光參控股公司共同構成。紫光軟件系統有限公司事業部包括通用產品事業部、通用系統事業部、公安應用事業部、政府應用事業部、電子檔案事業部、行業系統事業部、智能系統事業部、數字城市事業部、智能交通事業部和新聞媒體事業部；紫光軟件系統有限公司參控股公司主要包括紫光捷通、紫光新華、紫光文通、紫光德潤、紫光日新、紫光凱遠、廣西紫光等下屬專業公司；應用管理中心則作為紫光軟件系統有限公司內部職能部門及業務支撐部門，協同各部門開展工作。
今年初，通用系統事業部為給用戶提供專業的多媒體教學軟件及網絡培訓平臺而成立了北京傳寶網絡科技有限公司。公司以傳寶系列產品的研發、技術服務及系統集成為主要業務，成功開發了傳寶多媒體易教易學系統軟件，經過半年多的發展現客戶已遍布各行各業，形成了廣大的客戶群。