負責起草本市水污染防治、生態保護方面的地方性法規草案、政府規章草案，擬訂有關規劃、標準，并組織實施；依法對水污染防治實施統一監督管理，并承擔相關行政許可工作；建立和組織實施跨區縣界水體斷面水質考核制度；組織開展生態環境質量狀況評估工作；監督對生態環境有影響的自然資源開發利用活動、重要生態環境建設和生態破壞恢復工作；組織開展農村污染防治和生態保護工作；指導生態示范建設和生態農業建設；承擔重大生態破壞事件調查處理工作；組織對新建自然保護區提出審批意見，依法對各類自然保護區的管理進行監督檢查。