通州區(qū)第二中學(xué)為北京市首批完全中學(xué)。前身為建于1904年的通州女童蒙館，由美國基督教會公理會海外布道會傳教士富善慕柯在學(xué)道院基礎(chǔ)上改辦。1905年該校名為富育女子學(xué)校。著名校友有李德全、楊崇德。1927年學(xué)校改稱私立富育女子中學(xué)。1951年7月為河北省任命政府接管，改名為河北省立通縣女子初級中學(xué)。1959年起兼收男生。1960年改稱北京通縣第二中學(xué)。1974年增設(shè)高中部。

學(xué)校校園占地3.13公頃。建筑面積11946平方米，主要有建于1929年的硬山調(diào)大脊式教學(xué)樓、1985年建的教學(xué)樓和2001年建的3座西洋式小樓。圖書館藏書4萬余冊。電化教育設(shè)備齊全。

現(xiàn)有教學(xué)班初中42個，高中18個，學(xué)生總計3000人。教職工172人，其中專職教師110人。教師中有高級職稱的30人，碩士課程結(jié)業(yè)者12人，有大專以上學(xué)歷102人。1988年以來，學(xué)校先后舉辦了聲樂班、合唱團(tuán)、管樂團(tuán)、舞蹈隊、美術(shù)書法小組及各種球類、田徑隊。90年代以來，在多項美育類競賽中獲市級獎16項，向藝術(shù)院校輸送了57名學(xué)生。

自1990年，在高三年級設(shè)高考班和職業(yè)培訓(xùn)班。職業(yè)培訓(xùn)班學(xué)生通過高中會考和培訓(xùn)考核，發(fā)給高中學(xué)歷和職業(yè)等級雙證書。先后開設(shè)文秘、商貿(mào)等9個專業(yè)，對口輸送了613名雙證書畢業(yè)生。1995年與北京市房地產(chǎn)職工大學(xué)合辦大專班，為首都古建筑業(yè)培養(yǎng)了117人。1992年，被北京市教育局命名為“全面育人，辦有特色”學(xué)校和北京市美育工作先進(jìn)集體。1987年起參加國家教委重點教育科研項目“中小學(xué)生心理能力發(fā)展與培養(yǎng)”實驗。學(xué)校是聯(lián)合國教科文組織在北京進(jìn)行“創(chuàng)業(yè)教育”的實驗校之一，教學(xué)學(xué)科承擔(dān)北京市科教所“初中數(shù)學(xué)建構(gòu)模式教改實驗”。

1988年以來，學(xué)校先后舉辦了聲樂班、合唱團(tuán)、管樂隊、舞蹈隊、美術(shù)書法小組及各種球類、田徑隊，在多項美育類競賽中獲獎。1992年被北京市教育局命名為“全面育人，辦有特色”學(xué)校和“北京市美育先進(jìn)集體”、“電化教育先進(jìn)校”。2003年通過北京市中學(xué)規(guī)范化建設(shè)驗收。多年來學(xué)校初中畢業(yè)生考入市、區(qū)重點高中的學(xué)生數(shù)量始終位于全區(qū)**。