蒼南縣第二實驗小學創辦于清光緒32年(1906年)，學校以師資雄厚、治學嚴謹享譽浙南，慕名而來求學者不乏其人，楊忠道、蘇淵雷、蘇步青、李銳夫等名家曾在本校學習過。學校辦學成效顯著,1990年12月被蒼南縣人民政府命名為“蒼南縣第二實驗小學”。1993年秋學校遷入現址。

近年來,學校確立“育人為本，質量，突出特色，全面發展”的辦學理念,恪守“以學生發展為本，為學生一生奠基”的教育思想。堅持走教育改革實驗和特色化教育之路，以小班化教育為“載體”，以英語教學和藝術教育為“兩翼”，以教育技術信息化為“助推器”，全面實施素質教育。

學校被評為浙江省示范小學、現代教育技術實驗學校、**教育科學實驗學校、少先隊全國紅旗大隊、溫州市文明單位、溫州市紅領巾示范學校、溫州市推行《國家體育鍛煉標準施行辦法》先進學校、溫州市中小學日常行為規范達標學校、溫州市紅領巾示范學校、蒼南縣綠色學校等稱號。