楓溪二小校址原在楓溪大巷大夫第，辦學始于1963年9月.“文化大革命”期間的1969年，楓溪集鎮內學校統一合辦成一個“五七”學校，大夫第改為第二分教處。1964年秋，為滿足廣大陶瓷職工培養后一代的強烈要求，由陶瓷系統主辦“陶瓷職工子弟學校”.校址在原楓二村瓷廠，同時在宮后、三角埕和長美設立了三個分教點，共有16個班的辦學規模。1977年，因教育布局的重新調整，陶瓷職工子弟學校小學部并入大夫第分教處，同時復名楓溪鎮第二小學；時設于元合內、由商業系統主辦的學校改名楓溪鎮**小學；設于五房祠的“五七”學校**分教處改名楓溪鎮第三小學；長美分教點改為楓溪鎮第四小學（后并入長美小學）。隨后，各校的其它分教點隨校本部校舍擴建而逐漸歸并撤銷。

1983年，由楓溪鎮政府主持，在楓一村的支持下，易地另建二小新校園，并于1984年9月從大夫第遷至現址太合興路1號。1986年9月，元合內之楓溪鎮**小學并入五房祠之楓溪鎮第三小學。1988年9月，三小遷入二小現址，兩校合并成新的楓溪鎮第二小學。

1995年12月，楓溪建制由鎮改區，遂更名：楓溪區第二小學。

2008年9月，與楓溪小學合并成新的楓溪小學，成為楓溪區規模大的學校。