大連醫科大學基礎醫學院的前身為基礎部，始建于1952年，是全校設立院、系早的二級學院之一，1996年更名為基礎醫學院。我國著名的老一輩科學家教育家吳襄、魏文漢、伍律等曾先后在本學院任教。目前，學院不僅有治學嚴謹、頗有學術造詣的教授，還有一批富于創新精神、站在學科前沿的中青年學術帶頭人以及出類拔萃充滿活力的青年骨干教師，他們正在為躋身國內學院目標而努力奮斗。　　學院現有生物技術和預防醫學2個新辦專業。下設解剖學、細胞生物學、組織胚胎學、生物化學、生理學、免疫學、微生物學、寄生蟲學、病理學與法醫學、病理生理學、衛生學、流行病學、衛生統計、微生態學、食品營養與安全、生物科學、生物技術、計算機和運動醫學基礎19個教研室，此外還有機能學、形態學、病原生物學、生物化學與分子生物學、生物技術、食品質量與安全和校院共管的中心實驗室。　　基礎醫學院現有遼寧省重點學科6個：生物化學與分子生物學、病理學與病理生理學、生理學、人體解剖與組織胚胎學、病原生物學、勞動衛生與環境衛生學；遼寧省重點實驗室4個：醫學細胞分子生物學重點實驗室暨大連醫科大學中心實驗室、腦疾病重點實驗室、糖生物學與糖生物工程重點實驗室和癌癥基因組學重點實驗室。遼寧省高校重點實驗室4個：遼寧省省級高校腦疾病研究重點實驗室、遼寧省省級高校癌癥基因組學重點實驗室、遼寧省高校腫瘤轉移研究重點實驗室、遼寧省高校蛋白質組學重點實驗室。　　學院擁有一支結構合理、素質較高的教師隊伍。截止2008年初，共有教職工253人，其中專任教師207人（教授、副教授106人；具有博士學位58人，碩士學位114人）。現有博士生導師24人，碩士生導師60人，國家人事部有突出貢獻中青年2人，遼寧省中青年學科帶頭人2人，遼寧省3人，國務院政府特殊津貼獲得者12人，遼寧省教學名師1人，遼寧省高校學科拔尖人才1人，遼寧省高等學校人才支持計劃3人，遼寧省普通高等學校專業帶頭人1人，遼寧省青年骨干教師18人，遼寧省百千萬人才百人層次12人，遼寧省百千萬人才千人層次7人，霍英東青年教師基金及青年教師獎2人。有47人次獲得132項校級以上各種榮譽稱號。　　目前基礎醫學院承擔全校本科各專業96門課程，同時還承擔博士、碩士研究生、留學生等各層次的授課任務。　　基礎醫學院始終堅持實施本科教學質量與教學改革工程，已取得一批有較大影響的教學成果。在全國較早地進行了機能學實驗教學改革；目前正在進行神經科學、發育生物學的理論教學改革和形態學、病原生物學的實驗改革，為以基礎醫學學科及基礎與**學科之間的課程整合為特點的教學改革打下基礎。自2004年以來，該院共獲得教改立項課題24項，其中國家級2項，省級課題7項，校級課題15項。2004年以來，該院獲得了25項教學成果獎，其中包括省級教學成果獎11項，校級教學成果獎14項。病理學與病理生理學（03年）、微生物學（04年）、生物化學和衛生學（05年）、組織胚胎學（06年）、生理學（07年）被評為遼寧省精品課程。主編教材39部，其中規劃教材9部。2006年唐建武教授主編的《病理學》獲全國教材二等獎；仲來福教授主編的《衛生學》和張卓然教授主編的《**微生物學和微生物檢驗》獲三等獎；黃敏教授主編的《醫學微生物學》獲得遼寧省普通高等學校省級精品教材稱號；5部主編教材選題列入“衛生部‘十一五’國家級規劃教材”。　　學院科研氛圍濃厚，取得了一系列的科研成果。一些學科的主要研究方向在其相應的學術領域具有很高的學術影響力和優勢。2004年以來共承擔縱向課題113項，其中包括1項專項基金在內的國家自然科學基金26項；承擔教育部、遼寧省等各類基金49項，市級各類項目10項；總計獲縱向科研經費資助金額達1577余萬元。學院先后與美國、日本、德國、澳大利亞、加拿大、瑞典和韓國等國家的多所院校和科研機構建立了友好合作關系，先后選派14名教師赴國外和港澳臺地區進行學術交流訪問和深造，定期邀請國、內外著名學者來學校學院講學及指導教學、科研工作，建立國際合作項目17項。近三年在各級學術刊物上發表學術論文870篇，其中被SCI收錄的學術論文92篇，在國家級專業期刊（或核心期刊）上發表論文700余篇；獲國家、省部和市級科研成果10項；獲國家專利授權5項。通過高水平的科學研究，有力地促進了本科教學水平的提高。