廣東省農業科學院畜牧研究所創建于1952年，主要從事畜禽遺傳育種、動物營養與飼料科學、水產科學、動物保健品研究與開發。建有畜禽育種國家重點實驗室、農業部華南動物營養與飼料重點實驗室、農業部飼料效價與安全評價中心、廣東省動物育種與營養公共實驗室、廣東省畜禽育種與營養研究重點實驗室等科技創新平臺。2011年，廣東省農業科學院水產研究中心與畜牧所合署辦公。所內建有國家級惠陽胡須雞保種場、國家級烏鬃鵝保種場和5家高新技術企業。科研場地總面積超過14000m2，成果示范基地10多萬m2。研究所配備科研儀器100多臺/套，總體達到國際先進水平。
全所科技人員160人，其中博士 35人、碩士 55人、高級職稱35人，包括全國先進工作者1人、全國杰出專業技術人才1人、新世紀百千萬人才工程國家級人選2人、國家現代農業產業技術體系崗位科學家4人（其中3人擔任功能研究室主任），廣東省現代農業產業技術體系崗位2人。
"十五"以來，主持完成了國家863計劃、973項目、國家自然科學基金、國家發改委高技術產業化專項、948項目等國家、省（部）級及其它科研項目500多項，榮獲國家、部（省）級重大科技成果獎勵 30項，其中國家科技進步二等獎6項、省部級一等獎 20項，獲得發明專利9項。主辦《廣東畜牧獸醫科技》、《飼料科技通訊》、《飛禧特通訊》,每年發表學術論文100多篇。