廣東藥學院藥物研究所成立于1995年，2009年4月與美國Austar Pharma公司合作建立聯合實驗室，藥物研究所現任所長為陳燕忠研究員，副所長為林華慶教授、何偉教授
主要研究方向包括藥物控（緩）釋制劑、透皮控釋制劑、中藥新劑型、新藥質量標準、新藥藥理等，新型口服緩控釋制劑的研究,包括藥物骨架控釋系統,定時定位脈沖釋藥系統,滲透泵,定位粘附釋藥系統,新型骨架材料,控釋材料及相關輔料，非口服給藥系統的研究,包括透皮給藥系統和速釋給藥系統，中藥創新藥物和中藥新劑型開發生物技術藥物傳遞