國家海洋局第二海洋研究所創建于1966年，是一座學科齊全、科技力量雄厚、設備先進的綜合型公益性海洋研究機構。主要職能是從事海洋基礎研究、應用基礎研究和高新技術研究，促進海洋科技進步，為海洋管理、公益服務、海洋經濟發展及海洋安全提供科技支撐。作為國內從事海洋調查與研究的主要單位之一，建有一個國家重點實驗室——衛星海洋環境動力學國家重點實驗室和三個國家海洋局開放實驗室——國家海洋局海底科學重點實驗室、海洋動力過程與衛星海洋學重點實驗室、國家海洋局海洋生態系統與生物地球化學重點實驗室以及一個所級重點實驗室——工程海洋學重點實驗室，包含海洋工程勘測設計研究中心、檢測中心、海洋標準物質中心、海洋科技信息中心等技術服務機構和技術支撐體系。擁有與國際接軌的、可用于近岸到深海海洋調查研究所需的、總價值上億元的多專業內外業儀器設備。