國藥控股安徽有限公司是國藥控股股份有限公司和國投藥業安徽有限公司按照現代企業制度改制建立的新公司，由國藥控股股份有限公司控股。新公司注冊資金5000萬元，主要從事藥品和醫療器械等供應的供應鏈服務。公司堅持以“關愛生命、呵護健康”為企業理念，嚴格按照GSP管理制度規范經營，內抓管理，外拓市場，與國內眾多醫藥廠商和省內各大、中型醫院建立了廣泛的業務往來，構成了體系化的服務網絡，確立了優良的企業品牌聲譽，經營業績顯著，綜合實力增強，曾被安徽省食品藥品監督管理局評為優質管理、優良效益“雙優”藥品經營企業并獲得表彰。
公司將致力于打造安徽現代醫藥物流標桿企業，依托國藥控股一體化運營戰略和營運平臺，充分發揮資源配置優勢，拓展企業發展空間，在原有經營的板塊中增加醫藥行業第三方物流業務，將社區醫療服務和新農合作為終端網絡建設重點，提高基本用藥目錄藥品以及急救藥品的儲備和配送能力。新公司將建設高標準的現代醫藥物流，進入全國一體化的醫藥物流網絡，為安徽醫藥行業走向集約化、規模化、電子商務化管理做出應有的貢獻。
2009年5月做為合肥市政府引進項目國藥控股決定在合肥市經濟技術開發區投資1.2億元興建大型綜合性物流中心并于2011年投入使用，面積約2.4萬平方米，集辦公、倉儲、物流等功能于一身。物流中心設計規模為日常儲量近20萬箱，高架立體倉庫，自動分揀，自動巷道堆垛機，溫濕度嚴格控制，全信息化管理。物流配送中心一期由高架庫、叉車庫、揀選作業區、拆零庫、冷庫、藥品庫、毒性藥品庫、中藥飲片庫、中藥材庫、中藥飲片分裝、中藥養護熏房、驗收養護室、串味藥品庫、醫療器械庫、非藥品庫、異味藥品庫、貴重藥品庫、不合格品庫等以及相應的空調、配電、冷凍、更衣、辦公及計算機信息系統和控制等輔助設施組成。