50多年前，愛國民族資本家章榮初先生在辦廠經商中深感人才之重要，為造福桑梓，出資購地70畝，興建了一所環境優美、設施的中學。50多年來，學校歷經風雨，經過全體師生員工的不懈努力，創造了輝煌的歷史。如今，一所高規格的現代化的新菱湖中學已屹立在浙北大地上，正不斷向前發展。

1933年，菱湖籍愛國民族資本家章榮初先生出資購買了菱湖鎮南柵榜眼廳南20畝土地（即現在菱湖糧管所范圍），建造了青樹小學。1934年2月正式開學。1940年3月，校舍被日軍燒毀。抗戰勝利后，章榮初在上海發起成立菱湖建設協會，把恢復青樹學校作為首要工作。1946年初，章榮初以私宅作教室，招生開學，并購地重建學校，1947年學校落成，定名青樹中小學。占地70畝，設施齊全，堪稱。學校設董事會，由潘公展任董事長，吳淮清任校長。一切經費均由章榮初負擔。1950年，嘉興專署文教局委派陳柱麟、陳守仁到青樹中小學任正副校長。1952年，吳興縣人民政府接管青樹中小學，改名吳興縣初級中學，由縣長田一民兼任校長。1956年，始招高中，成立完全中學，改名吳興中學。仍由田一民兼任校長，馮團任副校長。1959年，由縣長劉健民兼任校長，秦禎禮任黨支部書記。首屆高中畢業生高考成績名列全省第二名，學校先后被評為縣、地區、省先進單位，成為省重點中學和浙江大學附屬中學。1960年，獲“全國文教戰線先進單位”稱號。1964年，學校改名為菱湖中學，沿用至今。

1981年，湖州市政府決定撤銷菱湖鎮人民中學，所有班級、校舍（原菱北完小部分除外）及部分教職工并入菱湖中學。1983年學校榮獲“全國群體工作先進單位”稱號。1984年再度被確定為省第二批重點中學。1998年4月，省教委評估組對該校進行了省二級重點中學的認定性評估，同年7月，省教委正式下文，批準該校為省二級重點中學。

1978年以來，在上級黨委和政府的支持下，學校多方籌措資金，先后新建、改建教學設施共計10800M2。1997年又籌資200余萬元，重新調整校園布局，使校容校貌有了較大改觀。與此同時，學校還大力推進現代化教學，投資建成了設備的計算機房，各處室配上電腦，并與國際互聯網聯通，步入信息高速公路。

在改善辦學條件的同時，學校始終把德育工作放在首位，做到教書育人，管理育人，服務育人。堅持以教學為中心，學校領導深入教學**線，堅持兼課，建立領導聯系年級組制度，加強教學管理，努力提高教學質量。