牡丹區第二十一中學占地62畝，現有南城，以及中心校區2個校區。始建于1982年，名為城關一中，1984年更名為菏澤市牡丹區第二十一中學，學校現有教職工367人，其中專任教師273人，教職工中研究生或研究生進修班畢業者7人，本科學歷72人，專科學歷295人，專任教師學歷達標率100%。有省、市區級以上教師38人，高級教師49人，市級以上優質課能手獲得者達114人次，其中省教學能手3人，國家級優質課獲得者3人。學校現有98個教學班，在校學生9000余人。
學校發展目標是努力培養學生良好的行為習慣和思維品質，為學生的終身發展奠基；立足二十一中實際，以校本教研為主要方式，促進教師專業化發展，使老師具有書卷氣質、文化氣質、學者氣質；打造文明、積極、關愛、互助的人文環境，構建有利于師生發展的和諧校園。 學校幾年來共計投資1000余萬元，教學面積和現代化基礎設施逐年遞增，現有教學樓、辦公樓6座，綜合功能樓1座。現代化教學和辦公設施全市。現擁有微機室8個，生物、化學、物理實驗室8個，大型多媒體教室、語音教室、學校電視臺、信息中心、音像資料庫各一個，閱覽室、圖書室4個，圖書擁有量50000余冊。音樂教室4個，均配備電子琴、電視、VCD等。音樂、體育、美術器材室3個。今年學校又投資300多萬元，安裝辦公室、教室空調，將60多所教室建成配備高清晰度投影儀、多媒體計算機的網絡教室。新增教師備課微機200余臺，目前學校微機擁有總量750臺，在全區初中微機擁有總量多。完善了校園網，實現無紙化辦公，教師工作組之間、辦公室與教室之間實現了網絡資源共享。 學校積極進行課堂改革，探究“學法指導、學練糾正”的教學模式。多方面發掘學生潛能，積極開辟第二課堂，每年有大量學生獲得各種獎勵，并在中考時得到高中免試和相應加分機會。我們的中考成績、升學人數、特優生、率、合格率多年來連續位居全區之首，在牡丹區教育系統綜合評估量化中，名列**，贏得了良好的社會信譽。 近年來，學校先后被評為“省級精神文明單位”、“山東省教書育人先進單位”、“山東省中小學德育工作先進集體”、“山東省初級中學教學工作先進單位”、國家重點課題“計算機與各學科課程整合實驗學校”、“山東省電化教學示范學校”、“山東省教育科學研究重點試驗基地”、“山東省大面積提高教學質量試點學校”、“山東省德育工作先進單位”、、“山東省初中教學示范化學校”、“山東省校本培訓示范化學校”、“山東省地震科普示范學校”、“2001-2005年全省普法依法治理先進集體”、“菏澤市依法治校示范學校”、“菏澤市教學工作先進單位”、“菏澤市政風行風建設示范窗口單位”、“菏澤市禁毒工作先進單位”、“菏澤市藝體衛工作先進單位”、“菏澤市思想政治工作先進單位”、“全市服務先進單位”等榮譽稱號。 新形式，新挑戰，21中將繼續以踏實的態度、改革的精神努力工作，爭取更大更好的發展。 現任校長李香鳳。
