學校現有高中教學班43個，學生2300多人，教職員工150人；硬件建設達到省一級重點高中標準。按國家規定的I類標準配備教學儀器和電教設備。學校投資300萬元建立完整的校園網絡系統和通訊廣播系統。1校園內有400米標準塑膠田徑場和體藝館，配有多個籃球場、排球場、網球場等各種體育設施。學校食堂、學生公寓由浙江大學新宇物業有限公司負責規范管理，設施，開湖州中小學后勤管理社會化之先河。2002年該校成為省第三批現代化教育實驗學校。
在師資方面，學校擁有一支**精干的師資隊伍。專任教師120余人，任課教師具有大學本科以上學歷的占94%以上，中級職稱教師占教師總數的45%以上，高級職稱的教師占教師總數的30%以上。同時有省市各級教育明星、名教師、教學能手、教壇新秀10多人，具有碩士學位的教師3人。
1995年下半年該校被認定為浙江省首批示范性綜合高中。新型的辦學模式和出色的辦學成果得到國家教育部領導和**教科所的肯定，學校也在省內外享有一定的影響。1997年10月29日《中國教育報》在中學課程改革系列報道中以《學分制挺進高中校園》為題對南潯中學的辦學模式作了長篇報道，教育部基礎教育司、國家高級教育行政學院合辦的《基礎教育改革動態》1998年第10期刊登了該校教育模式改革的論文《探索學分制管理推進綜合高中實施素質教育》，各級教育報刊、雜志、電視等媒體相繼介紹南潯中學綜合高中的改革情況。
1999年5月，原浙江省教委在該校召開了浙江省首次綜合高中辦學經驗交流會，1998、1999兩年，學校先后被授予“區級文明學校”、“市級文明學校”、“省級文明學校”、“市教科研先進集體”、“省教科研先進集體”；2001年獲“市文明單位”。
2002年6月，浙江省綜合高中教育模式研究開題會在該校召開；學校教科研主課題《選科·學分制管理綜合高中》，獲省人民政府首屆基礎教育教學成果一等獎，學校教科研課題《中學生心理因素與德育工作層次性研究》，獲省學校心理專業學會論文評比二等獎；2003年該校被批準為首批省一級重點綜合高中；該校還被評為市級德育先進集體、湖州市讀書活動先進集體、湖州市校務公開先進單位。
2005年底，南潯中學再次順利通過湖州市“平安校園”考核與浙江省二級重點普通高中評估。
南潯中學一貫堅持“為了一切學生，一切為了學生，為了學生的一切”的教育教學理念。在教學方面，學校嚴格按國家課程計劃開足開好各門課程，抓實抓好。在課程設置上，進一步體現了“以人為本”的精神，面向全體學生、使學生全面發展。
學校按普通高中要求開設規定的學習課程，并充分挖掘在校教師的潛能，在高中各年段開設了選修課和興趣小組。學校還利用課余時間發揮廣播電視網絡系統完備、圖書館閱覽室寬敞、活動場地較齊全的優勢，引導學生拓寬知識，健身強體。
校團委成立了讀書俱樂部、昕星文學社、創意漫畫社、籃球俱樂部和足球協會等學生社團，既豐富了學生的業余生活，為學生提供了展示自我的舞臺，也發展了學生的興趣愛好，讓學生在快樂中增進修養，提高素質，并滿足了學生不同的特長和興趣愛好和不同層次的需求。
2012年在湖州市教育局的大力支持下，加拿大BC省費南教育局與湖州市南潯中學簽署中加國際合作辦學協議，實施“1+2”中加合作辦學項目，即高中10年級（高一）在南潯中學就讀，注冊加拿大BC省高中學籍，引進加拿大課程體系、原版教材、教師和學分考評體系，讓學生提前體驗原汁原味的西式教育，修讀加拿大高中畢業文憑學分。
11、12年級（高二、高三）轉入加拿大BC省費南教育局下轄高中就讀，與加拿大本土學生一同上課，寄宿加拿大白人家庭，感受真正的加拿大教育，完成加拿大高中學分課程，取得加拿大高中文憑，直接申請加拿大、美國等世界大學。
在教科研方面，學校積極組織教師學習現代教育思想理論，了解國內外教育改革的新動態，探索新課程體系。該校承擔的《中學生心理因素與學校德育工作層次性研究》課題獲省三等獎，申報的兩個國家級課題《綜合高中教育模式的研究》的子課題《實施綜合高中教育模式與途徑研究》和《優質學校的理論與實踐研究――21世紀中小學教育改革的探索》的子課題《城鎮化進程中的綜合高中優質化行動研究》，正在探索研究之中。
校園的易地新建給學校的發展帶來了前所未有的契機，湖州市人民政府、南潯鎮鎮政府、市教育局的關心，南潯人民的大力支持是我們南潯中學前進的動力，兄弟學校的經驗與指導是該校發展的助跑器。2005年底，該校又順利通過浙江省二級重點普通高中的驗收評估和湖州市“平安校園”的檢查考核。我們有信心在第十一個五年計劃里，再創佳績，辦出特色，辦出成果，爭創省級文明單位和省一級重點普通高中，把南潯中學的教育辦成讓老百姓滿意的教育。
南潯中學辦學83年來，英才輩出，著名作家、詩人徐遲，生物學家、原北大校長張龍翔，中國音協常務副主席孫慎，我國**代飛機設計師徐舜壽，原**委員、國務院研究室主任桂世鏞等為該校的歷史增添了燦爛的一頁；更有兩萬多名畢業生走向高校、走向社會，為國家建設辛勤奉獻。近年來學校教育質量穩步提高，高考上線率一直穩定在較高的水準，贏得了良好的社會聲譽。
南潯中學設有張乃新獎助學金、叔蘋獎學金、南方通信高考升學獎、振奮獎助學金，每學年獎勵金額30萬元，以激勵學生努力學習。其中旅美華僑設立的張乃新獎學金不僅在高中階段對該校15名品學兼優、家庭經濟困難的學生每人每年頒發助學金2000元，還對該校畢業考入大學的學生在就讀大學一、二年級期間，每人頒發獎學金1萬元，以資助其完成大學學業。
2006年10月13日上午，南潯區“潯溪杯”中小學田徑運動會在南潯中學隆重舉行。
2010年6月17日，市教育局組織陣容龐大評估組對南潯中學進行了學校發展性評價試評估。
2011年9月3日上午，第26個教師節前夕，介紹副主席魏秀生在市教育局副局長徐新、南潯區副區長金順明的陪同下到南潯中學進行慰問。
