杭州余杭運河綜合保護開發建設有限公司是余杭區人民政府、杭州市運河綜保委、余杭區塘棲鎮人民政府三方共同出資組建的國有公司，注冊資金2億元人民幣，公司主要負責京杭運河（余杭段）的綜合保護和開發建設工作。