1978年7月高中因硬件缺乏停辦，部分高中教師調離，保留初中和小學部，仍稱水南學校。1978年至1984年，在縣體委指導下，開辦少體校（班），培養了一批運動尖子，在地區、縣運動會上頻頻奪魁。李月燕同學參加1983年省田徑運動會獲女子乙組800米第二名，朱菡在1982年地區二屆田徑賽上獲女子組800米、1500米、3000米三個**名。1983年，學校全面開展課外科技活動，先后成立了20多個課外興趣小組。年底科技作品4項獲省級獎，20項獲地縣級獎，學校榮獲縣、地區中小學課外科技活動先進集體。1984年第二課堂科技活動被省教委評為農村初中實驗中心先進集體，《麗水日報》、《浙江教育》分別報道學校開展課外科技活動的情況。1983年1月，葉一峰三兄妺事跡傳開后，《浙江日報》、《中國少年報》、《人民日報》都作了詳細報導。共青團省委、團**少工部派員專程來學校了解他們的事跡，并授予三兄妺少先隊員的光榮稱號。葉一峰同學被省教育廳評為省三好學生，并代表省少先隊出席全國少先隊工作會議，受到當時共青團**書記的接見，并合影。同志特別為葉一峰簽名留念。1983年9月，蔣曉珺、鄭曉慧、陳蓬、蔡建貞、周哲兵、陳建珍等女同學組成灣潭學雷鋒小組，每周末到上灣潭服務孤寡盲老人田法菊，一直堅持不懈。1989年12月縣委宣傳部、團縣委、教體局聯合發出《關于向灣潭學雷鋒小組學習的決定》，指出縉云二中灣潭學雷鋒小組是全縣繼葉一峰三兄妺之后的又一先進典型，號召全縣青少年向他們學習。

1985年3月水南學校初中、小學兩部分開，小學部分為水南小學，初中部下半年招收高中2個班成為縉云縣第二中學，一所完全中學，隸屬縣教體局直接領導，有班級16個，學生839名，教職工60名。2005年1月被省教育廳核準為省三級重點綜合高中。2011年8月，本校高中部撤并到縉云中學仙都分校，高中大部分教師和高中全部學生撤走，保留初中部，仙都初中并入本校。2012年8月，學校成為縉云縣五云街道中心校和教育聯盟牽頭學校，下屬有水南小學、城北小學和縣城16所民辦幼兒園，七里小學和仙都小學屬教育聯盟學校。縉云縣第二中學現有26個教學班，學生1086人，在職教職工115人。校園占地28682平方米，建筑面積14127平方米教育教學設施、設備先進。專任教師中研究生2人，本科學歷78人，大專學歷3人，合格率達100%；中學高級教師26人，中級職稱61人。獲省市縣教壇新秀17人，學科帶頭人5人，省市縣教師19人，市縣班主任12人，市縣師德楷模6人，他們教學教育經驗豐富。學校先后獲得“省學鋒樹新風先進集體”、“市級治安安全單位”、“市衛生先進集體”、“市綠色學校”、“市語言文字規范化示范學校”、“市師德師風建設達標學校”、“市級團工作先進集體”、“縣文明單位”、“縣文明學校”等榮譽。