嘉定三年（1210年）春，建成。了翁“以所聞于輔廣李燔者，開門授徒。”（《宋史·魏了翁傳》），以“博學、審問、慎思、明辨、篤行”為治學準則，適逢參加秋試的邛州學子沒有講習之所，了翁召他們來書院授業，由春而秋，“余乃約十余士之當赴類省試者，會文其上。是歲，自類元王萬里而下，凡得七人，其不在得中者，后亦接踵科第，或以恩得官，莫有遺者。”（《鶴山集》卷九十二《贈王彥直》）另在（《鶴山集》集卷四十一《鶴山書院始末》）中對這年的秋試作了同樣的記載：“考中者自而下拔，十而得八，書室俄空焉，人競傳為美談。”
秋試后，“士爭負笈從之”，絡繹不絕，為滿足教學需要，再擴書院規模。
嘉定四年（1211年）冬，了翁知漢州離去，從嘉定二年回鄉執喪辦學到嘉定四年，了翁親自在鶴山書院執教主講時間約一年半以上。
嘉定十一年（1218年），了翁生母譙氏亡故，請求解官回鄉，邊守制邊在書院講學。
嘉定十二年（1219年）到嘉定十三年（1220年），了翁仍居家守制，于書院講學。
嘉定十四年（1221年）前，于書院講學，后，知潼川。
嘉定十五年，了翁被召入京。
端平二年（1235年）十二月，宋理宗面賜魏了翁御書、唐人嚴武詩及“鶴山書院”四大字，嘉其辦學。此事載于《宋史·魏了翁傳》一百九十六頁，原文為：“朝辭，面賜御書唐人嚴武詩及鶴山書院四大字，仍賜金帶鞍馬，詔帝臣飲餞于關外。”后，了翁于宋理宗御書“鶴山書院”四大字后題了跋文。
嘉熙元年（1237年）三月十八日，了翁病死于蘇州，享年六十歲。
魏了翁弟子先后取進士及擔任高官者多人，著名的有：
游似，南充人，嘉定進士，吏部尚書，丞相。
吳泳，潼川人，嘉定進士，刑部尚書。
牟子才，井研人，嘉定進士，禮部尚書。
高斯定，蒲江人，紹定進士，工部侍郎，參知政事。
王萬里，蒲江人，嘉定類省試類元，太常博士。
程掌，丹棱人，紹定進士。
蔣重珍，無錫人，嘉定十六年舉進士**（即為狀元）。
………
魏了翁創辦的鶴山書院，通過講學，擴大影響，形成了鶴山學派。
元代
南宋末年，四川遭至宋、元（蒙）戰火的嚴重破壞，蜀士紛紛避難東南，其中也包括了魏了翁的一些門人，加之宋理宗時代“賜第宅蘇州”（《宋史·儒林七·魏了翁傳》），魏氏家族遷居蘇州，了翁死后也葬在那里。所以元代魏起（了翁曾孫）之時，已“莽為茂草”的鶴山書院沒有得到修復。但元代采用“治天下必用儒術”的建議，仍尊重儒士。
明代
鶴山書院重修二次。
明成化七年（1471年），邑令邵有良重修鶴山書院，現照錄清代《蒲江縣志》所載全文于下：
重修鶴山書院記
明進士邵有良邑令
鶴山書院魏文靖先生讀書處去治北一里許左跨白鶴寺右帶浴丹池長秋山環繞于前紫極觀擁護于后誠士人藏修所也開禧初先生以武學博士詔試七對策語甚切直御史徐相劾之遷校書郎以親老乞外補出知嘉州及史彌遠用事先生力辭不赴遂筑室鶴山所以問于廣燔二先生者授徒講學士爭趨之當時親炙先生之教如游似牟子才等皆一時名士及數百余歲而蜀之人尚知圣賢大旨豈非先生遺澤之所存乎愚去先生居若此之遠后先生出若此這遲然生行所著九經要義之傳于世者竊嘗誦而讀之被先生之教化有年矣第未升其堂而入其室耳成化庚寅由內官出知是邑即欲得先生之書院觀之詢諸父老曰不知也詢諸群吏曰不知也詢諸鄉大夫曰不知也蓋其堂室傾廢久矣越明年三月有民任姓者引而指之遂偕儒學會政馮亮往觀焉基址猶在磉砌僅存墨池方太許四面甃以石僉曰此古跡也嗟夫蒲自先生沒后典型凋謝久矣茲何幸哲人雖往里居住依然愛擇日命工筑室以新之環墻以周之雖其規模宏廣不克如昔日然亦足以俾士民知所重矣后之登斯堂而觀斯院者寧無高山景行之思乎若夫擴而大之則俟夫后之君子峕成化七年辛卯五月端午記
明正德十二年（1517年），御史虞雍重修一次。
清代
雍正二年（1724年），以魏了翁當南宋禁理學之時，獨能倡明正學以不墜，詔魏了翁入祀孔廟。
雍正三年（1725年）重建鶴山書院。
乾隆（已己年）冬，署令趙珺重樹鶴山書院石碑，現照錄清代《蒲江縣志》所載碑記全文于下：
鶴山書院碑記
國朝奉天鑲白旗監生趙珺署令
魏文靖先生理學名儒也當南宋時邪說簧鼓先生維持正學于圣道大有發明洵為中流砥柱余仰止之私已匪朝夕戊辰十月署篆蒲陽竊喜得觀先生講學之地因訪跡于邑人士僉曰治北里許有鶴山書院即古藏修所也歷任沿陋不葺日就傾圯前宰取墜椽頹柱于城中改建文昌宮移木主祀之自茲不復有書院矣余不禁慨然嘆蟲文靖先生在昔以正學開門授徒大有功于蜀士愚以為蒞斯土者正宜培書院以彰正學宗風是書院之當存猶餼羊之**輕去也奈何因其圯而廢之其于移祀之意果有當乎時欲仍故址以復先生書院會金川用兵糧運孔急不果其事越時年大兵進剿應夫供馬日迫于役未果既而妖氛掃蕩天子以川民疲于軍務詔有司加意休息因不便以士木之功遽勞吾民則又不果秋九月瓜期有代檢視俸廉已罄于公事疇曩修復之愿意托諸空言中心怏怏不睽寢食九日以送客之成都偕僚佐陳君天章韓子玉書友人蔡靜軒出郭登高籍訪鶴山書院至則草蔓幽蹊棘羅廢址因批荒辟蕪得前明邑尹邵公遺碑一通洗捫字讀而識之咸以備知文靖事跡為快靜軒揖余而言曰夫古今物之興廢固本乎數然邵公以成化七年端午勒碑記事歷今幾三百年矣而此碑之埋沒于寒煙榛莽間者亦匪一日茲于重陽令節獲遇我公安知非文靖先生與邵公之靈爽有以使之耶公固好學士得斯奇遇蓋可忽乎哉余曰靜軒之言是矣余雖行裝已束就道有期然不敢懷將去之心令此碑臥蕪草鄰瓦礫而與廢院者同獲罪于古人也爰以敝裘市金稅匠筑基而豎之復以巨礎周其傍以防傾塌工成偕舊游諸君往觀雖空山岑寂而古柏森森之下有屹然特立于洗墨池邊者則鶴山書院碑也碑存即址羅叢棘蹊迷蔓草后亦有所考而出之可無虞其終沒于樵采矣于是諸君子相與稱慶余亦手額他日者茍余薄祿必果修復之愿一安先生與邵公之靈故勒石以志所遇倘后之君子踵而新之使文靖遺澤亙古常昭蒲之人士得趨正學則禮義之風于復古乎何有乾隆已巳孟冬塑日記
清乾隆三十四年至三十八年，知縣紀曾蔭改建鶴山書院，并親書“鶴山書院”四大字于照壁。后又于山麓建“魏氏故里”石牌坊一座。
乾隆五十三年（1788年）再重修鶴山書院。
1953年學校遷至鶴山書院山麓，現蒲江中學校址，山項書院原址辟為果園，嘗余一書有“鶴山書院”四大字的屏墻，亦于文革期間毀去。現火磚屏墻為蒲江縣宣傳部于1994年重建。
近況
學校歷史悠久，前身為南宋禮部尚書魏了翁于公元1210年創辦的“鶴山書院”。七百多年來，雖歷經滄桑，但書院“博學、慎思、明辨、篤行”的治學準則和艱苦奮斗、勤奮進取的優良傳統代代相傳，培育出了成千上萬的人才。著名愛國將領、對日作戰英勇犧牲的原國民革命軍第三十六集團軍總司令、陸軍上將李家鈺、著名化工杜長明博士、醫學徐國熙博士等就是他們當中的杰出代表。
解放后五十年間，學校先后培養的上萬名畢業生中，許多人也已成為國內外享有聲譽的、學者。
校址：四川省蒲江縣鶴山鎮了翁路1號
郵編：611630
