漣源三中的前身乃原純化中小，始創(chuàng)于1941年。校址在楊市鎮(zhèn)道公祠。1953年遷至現(xiàn)址佩蘭堂(“佩蘭堂”始建于清朝同治年間，是解放前漣源的地主莊園之一。其主劉鴻年是清末名將曾國藩的部將，后官至江西道臺)，先改名為純化完小，后改名為楊家灘完小。1956年帶辦初中，1958年秋改名為“漣源縣第五初級中學(xué)”，1969年春，縣屬中學(xué)下放公社，改名為“楊家灘公社中學(xué)”，1970年，不再設(shè)置初中，開始招收高中班，12月，學(xué)校易名為漣源縣第三中學(xué)。1987年，漣源縣改為漣源市。學(xué)校名亦隨之改為“漣源市第三中學(xué)”。

2011年漣源南部高中重新布局，原立珊中學(xué)、漣源五中并入漣源三中，新規(guī)劃的漣源三中將按省級示范性高中建設(shè)，擴編到在校學(xué)生4000余人，新拓教學(xué)用地200余畝。，在職教職工128人，其中中學(xué)高級教師18人，一級教師42人。今日的三中人，在新的領(lǐng)導(dǎo)班子的帶領(lǐng)下，堅持管理興校、創(chuàng)新強校的治校方略，在教育教學(xué)改革的大道上奮勇前行。