前身系始創于1923年的西充縣立中學，1950年人民政府以抗戰時期遷入西充的原重慶巴蜀中學為基礎，合并了縣立中學和私立育英中學，更名為西充縣中學校，以巴蜀中學校址為校本部，原縣立中學校址為校分部。1953年，四川省教育廳按照當時的體制將西充縣中學校確定為省屬重點中學，更名為四川省西充中學校。

西充中學創辦于1923年，前身系西充縣立初中。1939年，重慶私立巴蜀中學為避免日機轟炸遷至西充縣城大佛寺所在地，創辦私立巴蜀初級中學，1945年，私立巴蜀初級中學招收高中生。1950年，人民政府以巴蜀中學為基礎，并入了縣立初中、太平鎮的私立育英中學，創辦了西充中學，定校名為“西充縣西充中學校”，西充中學以巴蜀中學校址為校本部，舉辦高中，以縣立初中校址為校分部，舉辦初中。1952年，四川省教育廳確定西充中學為省屬“重點中學”，定校名“四川省西充中學校”。1956年校分部劃出，成立城關中學；1961年城關中學停辦，再次設為西充中學分部；1976年劃出校分部，成立晉新初級中學。1980年西充中學被確定為南充地區重點中學，1994年停辦初中，擴大高中規模，1996年完成高完中辦學要求的達標驗收，被重新確定為南充市重點中學，命現校名，1999年相繼接受和通過省教育廳的組的檢查驗收，被確定為四川省校風示范學校和四川省重點中學，2001年，兼并西充縣實驗中學，恢復初中，成立初中分部，2002年被評為四川省示范性普通高中。