隨著我國國民經濟持續快速發展和城市化進程的明顯加快，軌道交通產業迎來了新的加速發展時期。為構筑南京市產業新基礎，建成長三角先進制造業中心，南京市提出了打造軌道交通產業鏈，構筑產業發展和產業競爭新優勢的戰略部署，引導和推動南京軌道交通產業更好更快的發展。
軌道交通包括地鐵、輕軌、磁懸浮等多種樣式，從項目的設計、施工到終的運營，南京軌道交通企業基本覆蓋了各個環節。南京地下鐵道有限責任公司在工程建設管理、運營、咨詢方面具備先進的管理理念和成功的經驗。中國電子科技集團公司第十四研究所是國家發改委定點的信號系統國產化總成單位，在CBTC等先進體制的列車控制系統方面獲得了突破，為南京、上海等城市提供了信號系統，同時，基于列車行車調度系統（ATS）統一平臺完成了軌道交通綜合自動化系統的研發，并成功向軌道交通總承包方面拓展，先后承接了巴基斯坦卡拉奇軌道交通1號線EPC總承包項目及約旦輕軌EPC總承包項目。車輛制造方面，浦鎮車輛廠的設計和制造能力吸收了國際大公司的先進技術，已經制造出國際的車輛產品提供給上海、南京等城市，并進入海外市場；南京康尼是列車門系統的國產化先鋒和主要供應商；南京華士是車載電氣設備重要集成和生產廠商，他們都已成為列車車輛系統產業鏈配套供應商。熊貓電子集團有限公司引進、消化、吸收國外先進的自動售檢票（AFC）系統技術，自主開發了票務清算管理中心（ACC）系統及AFC專用配套設備，產品銷往南京、北京等城市，并出口海外，成為國內AFC、ACC系統及配套設備的主要供應商之一。國電南瑞、國電南自是我國電力保護與控制系統方面的領導者，在廣州、北京、德黑蘭等地鐵的建設中積累了豐富的SCADA系統經驗，同時正在向軌道交通交通綜合監控系統方面拓展。南京消防股份和南京消防集團則是消防技術、產品和市場份額國內的消防系統設備供應商。此外，南京還有南京普天通信的通信系統和設備，南京曼奈克斯的檢修電源箱設備，天加空調、五洲制冷的空調系統，藍深制泵的給排水系統，菲尼克斯的電接口器材等。在土建工程建設方面，南京嘉盛集團、瑪莎建材、華夏天成、中國水泥廠、南鋼等原材料供應商在相關領域極具競爭力。江蘇聯宏公司為南京地鐵建設了全國首個能源管理系統。南京地鐵在運營與資源開發方面圍繞運營服務拓展了多個經營領域，多元化發展優勢突出。目前南京軌道交通產業已經形成較為完整的軌道交通產業鏈。
2006年7月，南京市軌道交通行業的33家企業共同的家園—南京軌道交通產業協會在南京市經濟委員會的直接倡導和組織下成立了。這是一個溝通的平臺、合作的平臺、共謀發展的平臺。南京軌道交通協會的成立，標志著南京的產業結構調整邁出了重要的一步，裝備制造業在軌道交通領域有了長足的發展，也是南京打造長三角制造業中心的實質性進展。協會將在打造市場信息平臺、技術合作平臺、產品協作平臺，統一協調對外形象、聯合投標、聯合承接工程等諸方面繼續努力，實現南京軌道交通行業的大聯合。協會發展的高級形式將是具有更強市場競爭力的產業聯盟或股份有限公司，以EPC、BT、BOT、PPP等國際通行的承包模式承接更多國內外軌道交通項目。
在南京市政府的大力支持下，十四所正在積極籌備牽頭成立從事軌道交通總承包項目業務的公司—南京軌道交通系統工程公司。總承包公司將以南京市確立的軌道交通國產化示范工程為契機，結合十四所承接的海外總承包項目，不斷發展狀大，為全面、深入打造南京軌道交通產業鏈作出應有的貢獻。