南京旭東中學創建于1996年7月。初是由南化公司職工子女總校負責，委托當時的省級重點中學——南化一中管理的校內初中民辦班，取名為“宏志班”。招收學生為南化職工的子女，自愿報名即可錄取。教學模式大特色就是英語分小班實驗教學。選派總校內的骨干教師擔任班主任及各門教學管理工作。建班兩年后，因管理教學到位，辦學理念先進，原中等生源的學生在各類學科競賽活動中表現出眾，成績優異，受到家長的好評。不久，“宏志班”在本地區名聲大振，慕名而來的學生越來越多。到1999年，班級由原來的2個班逐步發展擴大到初中3個年級12個班級，成為一所較為正規的學校。2000年7月，由總校上報，經南京市教育局審核、批準，宣布該校正式。校部社在大廠葛關路80號（原南化總校辦公大樓處）。首任校長為劉成烈老師。學校也正式掛牌，被命名為“南京民辦旭東中學”。“旭東”二字含義深刻“一是她本身為南化公司總校創建，而南化公司的創辦人即知名的化工企業家范旭東先生，區此名可紀念這位為南化做出貢獻的名人；二是旭日東升象征著希望、朝氣、興旺，寓意下一代就像初升的太陽，充滿朝氣，茁壯成長。希望學校的發展前景輝煌發達。十年創業，不負眾望。在全校員工的共同努力、奮力拼搏下，業績斐然。從1999年開始，歷年中考，在南京十幾所民辦中學中名列前茅，為南京市省級重點高中培養了一批批品學兼優的人才，贏得了家長和學生的普遍贊譽，在本地區初級中學中，占有重要地位。2006年學校規模再次擴大，因原來校園狹小，遷入新校區開始新的發展。