截至2011年，高淳區擁有普通中學15所，其中：高級中學4所，初級中學10所，九年一貫制學校1所。擁有職業中學1所。擁有特殊教育學校1所。擁有小學31所，教學點13個。2011年，全區普通中學、小學和職業中學在校人數分別為16829人、18185人和3001人，分別比2010年減少1944人、增加331人和減少275人。特殊教育學校在校人數110人。擁有幼兒園33所，在園幼兒9856人。初中學生升學率為96.6%。