南通市崇川區教育體育局始建于1983年，初期名為城區教育局。2001年10月，撤銷崇川區教育局、崇川區體育運動委員會，組建崇川區教育體育局。崇川區教育體育局管轄南通市崇川區范圍內的九年制義務教育工作，現有小學35所，初中8所，特殊教育學校2所，全區在校在園學生共5萬余人。同時，還負責管理區內成人教育、社區教育、區域體育、全民健身及市內的高等教育自學考試等工作。

南通市崇川區教育體育局堅持以發展為主題，以結構調整為主線，以改革、創新為動力，以全面實施國民素質教育為主旋律，堅持基本實現現代化的目標，近年來不斷加大資源整合、配置的力度，擴張優質資源，改造薄弱學校，逐步形成了以實附小、示范初中為龍頭，以新村配套中小學為骨架的教育發展格局，為實現主城區“科教興區”的宏偉目標而不懈追求，穩步跨越。

建局以來，崇川區教育體育局先后榮獲全國特教先進區、全國城市體育先進社區、全國“雙有”活動先進集體、省教育技術裝備先進集體、省規范收費工作達標區、省普及九年義務教育和掃除青壯年文盲教育先進單位、省電化教育先進集體、省群眾體育先進單位、省自學考試先進集體和市知識分子工作先進集體等國家、省、市級的多項榮譽。