上海南站長途客運有限公司成立于2003年5月30日，是由上海交運巴士客運（集團）有限公司、上海交運股份有限公司、大眾交通（集團）股份有限公司和上海錦江商旅汽車服務股份有限公司四家公司共同出資的國內合資企業，注冊資本7500萬元人民幣。主要從事客運站經營、省際高速、省際班車、省際旅游、省際包車、貨物代理、物業管理等。
公司投資2億元人民幣興建的上海長途客運南站是上海市人民政府規劃白皮書中“四主六輔”省際道路客運站中的一個主站。項目占地面積約2萬平方米，總建筑面積約2萬平方米，分地下一層，地上四層。按國家一級客運站的設計標準和國際航站樓的設施標準建造。工程于2003年12月開工籌建，2005年10月竣工，并于同年12月對外營業。上海長途客運南站以國際航站樓的管理和航空式服務為標桿，努力打造“國際、國內”的客運站。
公司正式營運以來，經營規模迅速擴大，目前班線覆蓋全國13省200多個地區。全年到發車班70萬班次，旅客年吞吐量1500萬人次，行包年吞吐量50余萬件，年客票營收超過6億，市場占有率超過32%，客站經營規模居上海第二位，成為上海重要的公路客運樞紐港之一。
公司先后獲得了“全國模范勞動關系和諧企業”、“全國交通運輸行業文明單位”、“全國交通運輸文化建設示范單位”、“全國交通運輸客運行業首批優質服務示范企業”、“全國百強誠信客運站”，“全國首屆旅客滿意汽車客運站”、“上海市平安單位”、“上海市職工滿意企業”、“上海市文明單位”、“上海市五一勞動獎狀”、“上海市職工職業道德建設先進單位”、“上海市廠務公開民主管理先進單位”等榮譽稱號，公司司標被評為“上海市著名商標”， 公司“節假日大客流營運管理”被授予“全國交通企業管理現代化創新成果二等獎”，公司所屬長途客運南站被評為“上海市現場管理星級評價五星級現場”，“南站長途客運服務”被推薦為上海市“品牌服務”和“名牌服務”。