轉制后的上海市致遠中學充分依托上海市實驗學校的教改經驗，全面引進上海市實驗學校的辦學模式，以教育科研促學校整體發展，以精致管理促校園文化建設，充分開發師生智慧潛能，積極構建展能教育模式，計劃用三年時間，把上海市致遠中學建成一所具有教改實驗特色、教學質量優良、與上海市實驗學校教改實驗相銜接的浦東新區特色初級中學，2002年9月學校正式掛牌成為上海市實驗學校初中教育實驗基地。

上海市致遠中學從2001年7月開始，已招收了轉制后的多屆初中班學生，采用上海市實驗學校初中課程與教材，優化師資隊伍，由上海市實驗學校負責教師的業務培訓和教學質量監控。

上海市致遠中學將堅持“以學生發展為本，以能力發展為主”的辦學思想，堅持倡導“展能教育”，銳意改革，不斷進取，努力培養具有創新精神和持續發展能力的初中畢業生。2005年，首屆畢業生取得了可喜的成績，75%的學生進入了區重點以上的學校就讀，中考成績名列新區前茅。

上海市致遠中學初中學制為四年，初三畢業生中的學生，經上海市實驗學校驗收后，將推薦升入上海市實驗學校高中部學習。