為了落實國家戰略產業的持續發展，支撐廣東省和深圳市的產業轉型，加強集成電路與系統應用領域的產學研用結合，促進珠三角電子產業高質量創新。在深圳市科技創新委員會的指導支持下，由微電子與集成電路、硬件電路與系統、數字媒體與應用軟件、環保檢測與健康醫療等領域較有影響力的企業和共同發起成立深圳市微納集成電路與系統應用研究院。
研究院定位聚焦IC設計及系統應用基礎創新研究，同時關注數字家庭、精致生活、健康環保領域的創新研究。