根據國家知識產權戰略綱要的總體戰略目標，結合中國科學院科技布局調整的要求，圍繞深圳市實施創新型城市戰略，2008年1月，根據中科院關于由國科控股開展知識產權運營工作的有關要求，在一年多研究工作的基礎上，國科控股董事會通過決議,決定建立深圳中科院知識產權投資有限公司。深圳中科院知識產權投資有限公司由知識產權運營事業部門、知識產權培訓事業部門，業務支撐部門、行政支撐部門、市場發展部門五部分組成，同時設立專利信托運營中心。
深圳中科院知識產權投資有限公司是中國科學院一家知識產權商業運營公司，致力于整合中國科學院的優勢科技資源，開展技術轉移、成果轉化和企業孵化等相關知識產權運營工作。通過知識產權全過程運營管理，形成知識產權系統解決方案的服務基地；通過搭建知識產權信息管理平臺，形成知識產權信息庫的基地；通過創建知識產權創造平臺，形成知識產權的創造基地；通過建立知識產權運用平臺，形成知識產權轉移轉化基地；通過開展專業培訓業務，形成知識產權人才的培訓基地；通過專利的二次開發，形成專利池的運營基地。從而使公司成為“知識產權價值鏈的系統服務商和系統集成商”。