吳階平醫學基金會成立以來，在支持醫學科研和醫學學術交流、激勵廣大醫師提高專業水平、組織各學科的繼續教育及專科培訓、開展健康公益活動和科普宣傳、與相關企業合作建立專項基金、參與支持中醫藥的開發和研制等方面都開展了大量卓有成效的工作，為促進我國醫學和健康事業的發展做出重要貢獻。
近年來，我國肝病危害十分嚴重，受到吳階平醫學基金會領導的高度關注。為此，經有關多次論證，并經吳階平醫學基金會理事會批準，于2008年12月正式成立肝病醫學部（Liver Department of Wu Jie Ping Medical foundation）。吳階平醫學基金會肝病醫學部的工作主要是充分利用和發揮吳階平醫學基金會這一大型非政府慈善組織（NGO）的資源和優勢，團結國內外學者及其它社會力量，積極開展肝病知識宣傳、科學研究、**診療、預防、學術交流與教育工作、關愛救助，促進肝病新技術、新療法的推廣與應用，同時為相關企業搭建防治肝病的學術研究和繼續教育的平臺，以及為管理部門制定政策提供技術依據和科學信息。