萬頃沙中學創辦于1956年，建校初期，借用珠江口西岸的大角山海房做校舍。為了方便學生就近讀書，1963年遷到現址重建，有磚木結構平房六幢，建筑面積約2400平方米，校園用地面積為2230平方米。八十年代中后期，學校建設有了較大的變化，校園用地面積增加到14800平方米，新建一幢實驗樓和兩幢教學樓。隨著教學形勢的發展，學校的辦學條件與上級要求差距越來越大，在1996年的初級中學評估中被評為辦學條件、學校管理、教育質量薄弱學校。為摘掉薄弱學校的帽子，在區、鎮各級政府和教育部門的重視支持下及校友們的殷切關懷下，1997年，得到區政府的傾斜扶持，投入一千三百多萬元，對學校進行了全面的改造。改造后，學校的用地面積達20000平方米，建筑面積達13331平方米，教學樓、實驗樓、教師宿舍樓、學生宿舍樓、師生食堂、體育館分布有序；實驗室、圖書室、閱覽室、電腦室、語音室、音樂室、美術室、運動場等各類場室一應俱全。49年來，萬頃沙中學在各級領導的悉心指導下，不斷壯大和發展，擁有22個教學班，學生1312人，教職工72人。學校校風嚴謹，教學質量穩步提高，繼續成為在番禺大沙田地區有較大影響的初級中學之一。
