解放后，莒溪教育事業蓬勃發展，到了1957年，小學學生數已有上千人，小學畢業生數有一百多人，但初中卻要到六十里外的平陽二中或靈溪中學就讀。鄉政府根據當時黨和國家發展教育事業的“兩條腿走路”的方針，決定創辦“民辦”中學。在鄉政府的關注和發動下，一些熱心教育事業的有識之士（如劉際榮等）挺身而出，積極籌措經費，尋訪教師，確定臨時性校址，做了大量的籌備工作。1957年秋，“莒溪鄉民辦中學”應運而生，成為原平陽縣**所民辦中學。校址在偽鄉公所土墻房（原址與莒溪中心小學隔溪相望，后因新建“學前街”，土墻房已不復存在），辦學經費靠公助民籌解決，校長溫亦懂。學校建立校友會，主任由鄉領導林克增兼任，校委會成員盧立芳具體負責教學工作，劉際榮主管財務，教師2人，招收1個班，新生60人。1958年秋，民中發展到2個班，招新生48人，在校生計108人，教師增到5人，校址遷至教堂，更校名為“莒溪鄉農業中學”。受校委會委托，農中校務、教務、財務、生活分別由教師盧立芳、張友亮、陳尚勇、李榮鵬負責，學生使用全日制初中教材。1959年秋，再增1個班，學生總數達150人，教師增到7人，校址遷至西廳大隊的陳氏宗祠。確定盧立芳為農中負責人，李榮鵬為教導，陳尚勇為總務。1960年首屆50多名畢業生中，有15人考上平陽第二師范學校，3人考上杭州郵電學校，10人考上平陽第二中學，成績喜人。1961年，因國家經濟困難，學校經上級再三動員而停辦。

1963年學校重辦，招新生1個班13人，校長唐勛，名譽校長為鄉分管文教的蘭德仁兼任，校址在原莒溪中心小學的大禮堂。由于莒溪是原平陽縣**林場（現蒼南縣林場）所在地，故學校易名為“莒溪公社林業中學”。1964年9月招新生1個班25人，教師增加到5人，校址又遷至西廳大隊的陳氏宗祠。1965年9月，復遷校址于教堂，招新生1個班35人，同年還辦過夜初中。1966年，受文化大革命沖擊，學校再度停辦。1969年秋，學校再度恢復，作為莒溪中心校的附屬初中班，實行兩年制，使用省編教材。附中作為全日制初中，純屬公辦，以莒溪中心校正門大橋西首的一幢平房作為校址。1971年2月，附中還開設了夜高中班。1976年9月，附設1個高中班，1977年秋，高二班并入橋墩中學，附中續收2個高一班，一為公辦班68人，一為民辦班76人。1978年秋，高中公辦班又并入橋墩中學，初二學生經嚴格考試，擇優錄取少數學生升入橋墩中學，其余的學生實行初二改制考試，錄取部分學生繼續留校升上初三，1979年春高中民辦班畢業，此后停辦高中班。從此，學校由兩年制改為三年制，新生入學也由基層推薦為主改為經文化考試擇優錄取，并使用統一的全日制部編教材。附中階段，歷任中小學負責人為鄧翰、雷云貴、張仁霖、鄧倫喜。1983年2月，莒溪中學從莒溪中心學校分離出來，成為中學，全稱為“蒼南縣橋墩區莒溪初級中學”，劉妙生任**任校長，劉際堪為教導主任，教師13人，學生200人，仍在原校址。1984年5月，莒溪建鎮，由縣教育局撥款，在莒溪中心小學西側新建教學樓。1996年因開始普及九年制義務教育，秋季招生6個班，到1997年秋達13個班，在校生達715人。經蒼南縣教育局和莒溪鎮委鎮府努力，在溫州市工行、紹興市工商局、蒼南縣民政局、杭州百大集團等多家集團資助下，再次擇址莒溪村港內新建校舍，并于1998年3月遷入新址。2007年7月劉妙生校長退居二線，王孝敏任校長，鄭昌藝、雷必忠、蘭永忠分管教學、政教、后勤。

莒溪鎮初級中學創辦于1957年秋，系蒼南縣唯一的省級欠發達鎮——莒溪鎮的一所初中，至今六易校址五更校名，曾辦過兩屆高中班。現莒溪中學有10個班級，學生516人，校內設有圖書室、閱覽室、美術室、音樂室、物理實驗室、生化實驗室、電腦教室、校園廣播系統、200m煤渣跑道、籃球場、羽毛球場等，所有教室均有小媒體設備。教職員工35人，專任教師學歷全部合格，其中縣級教壇新秀4人，縣級教壇新苗1人，縣級學科骨干教師1人，縣級優質課獲獎者4人。教育教學質量近年提高顯著，2008屆畢業生98人，有3人被蒼南中學錄取，5人分別被靈溪中學和靈溪二高重點班錄取，40余人被橋墩高中等學校錄取。學校曾獲得蒼南縣“中小學實驗教學工作先進單位”、溫州市“推行體育達標先進學校”、蒼南縣“中學生日常行為規范達標學校”、蒼南縣“毒品預防教育活動示范學校”、蒼南縣“文明學校”、蒼南縣“學習型先進學校”、溫州市“中小學德育工作先進集體”等榮譽稱號，2007學年又先后被評為蒼南縣“中小學規范化管理工作先進單位”、蒼南縣“綠色學校”、蒼南縣教育系統“計生工作先進單位”、蒼南縣“教育宣傳信息工作先進單位”、蒼南縣教育系統“文明學校”，并于2008年順利通過市級教育強鎮、省標準化學校驗收。

學校現有9個班級，學生399人，占地總面積11800平方米，建筑面積3306平方米，校內設有圖書閱覽室、美術室、音樂室、物理實驗室、生化實驗室、電腦教室、校園廣播系統、200m煤渣跑道、籃球場、羽毛球場等，所有教室均有小媒體設備。教職員工35人，專任教師學歷全部合格，本科學歷占67.7%，其中縣級教壇新秀1人，縣級教壇新苗3人，縣級學科骨干教師2人，縣級優質課獲獎者6人，在2009年縣課堂教學評比中，3位教師全部榮獲一等獎。教育教學質量近年提高顯著，2009屆畢業生中有3人被蒼南中學錄取，8人分別被靈溪中學和靈溪二高全縣班錄取，近百人被橋墩高中錄取。學校2007學年先后被評為蒼南縣“中小學規范化管理工作先進單位”、蒼南縣“綠色學校”、蒼南縣教育系統“計生工作先進單位”、蒼南縣“教育宣傳信息工作先進單位”、蒼南縣“文明學校”，2008學年再次被評為蒼南縣“中小學規范化管理工作先進單位”和蒼南縣“教育宣傳信息工作先進單位”，2008年上半年順利通過市級教育強鎮和省標準化學校驗收，2008下半年又順利通過省級教育強鎮和縣品牌工會驗收，2009年以高分通過市農村初中學校四項教學規范達標評估驗收。