萬州實驗中學前身即“萬縣市第二初級中學”，簡稱“初二中”——1992年更名為“萬縣市實驗中學”，重慶直轄后，更名為“萬州實驗中學”——1993年創辦“四川外語學院附屬萬縣市外國語學校”，1998年創立“萬州外國語學校”。萬州實驗中學、萬州外國語學校實行兩塊牌子、一套班子、一體化管理的體制。學校為萬州區教委直屬重點中學，接受四川外語學院業務指導。2004年4月，學校已通過創辦重慶市重點中學區級驗收。