學(xué)院以溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院、附屬育英兒童醫(yī)院、浙江省立育英醫(yī)院為依托，實行“四塊牌子，一套班子”的管理方式，下設(shè)學(xué)院辦公室、教學(xué)管理科、學(xué)生工作辦公室。設(shè)有**醫(yī)學(xué)、學(xué)、中醫(yī)學(xué)、康復(fù)醫(yī)學(xué)四個本科專業(yè)及后期分流的兒科方向班，其中**醫(yī)學(xué)專業(yè)是國家一類特色專業(yè)和浙江省重點專業(yè)，也是我校招生設(shè)置早、招生數(shù)多、規(guī)模大的專業(yè)。擁有內(nèi)科學(xué)、外科學(xué)、婦產(chǎn)科學(xué)、兒科學(xué)、危重病學(xué)、中醫(yī)學(xué)、康復(fù)醫(yī)學(xué)等19個教研室。擁有內(nèi)科學(xué)、外科學(xué)、婦產(chǎn)科學(xué)、兒科學(xué)等16個碩士點和眼科學(xué)、外科學(xué)、婦產(chǎn)科學(xué)3個博士點。

學(xué)院院訓(xùn)為“誠信、奉獻、求精、創(chuàng)新”。

溫州醫(yī)科大學(xué)第二**醫(yī)學(xué)院有浙江省兒童呼吸疾病診療研究中心和浙江省脊柱外科中心兩個省級醫(yī)療中心，溫州醫(yī)學(xué)院兒科研究所、骨科研究所、疼痛研究所、神經(jīng)內(nèi)分泌研究所設(shè)在本院，有7個省級醫(yī)學(xué)重點（扶植）學(xué)科、3個中醫(yī)藥重點學(xué)科和4個重點專科。近三年獲得國家自然科學(xué)基金9項，獲得省自然等省部級課題37項，目前擁有正高職稱教師104人、副高職稱244人；具有碩士學(xué)位436人，博士學(xué)位35人；碩士生導(dǎo)師94名；博士生導(dǎo)師7名。
學(xué)院不斷拓寬和完善**實習(xí)基地的建設(shè)，已擁有臺州醫(yī)院、嘉興市**人民醫(yī)院、寧波市**人民醫(yī)院、上海交大醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院等二十余所教學(xué)及實習(xí)醫(yī)院。學(xué)院承擔(dān)留學(xué)生、碩士研究生、在職研究生和五年制全日制本科生的**醫(yī)學(xué)教學(xué)任務(wù)。