孝南區教育局是孝南區政府主管全區教育工作的職能部門，內設股室有辦公室、教育督導室、紀檢監察室、安全股、規劃財務股、基礎教育股、成職教股、審計股、人事股、資助中心和考試中心。二級單位有教學研究室、學校后勤管理辦公室、教育技術裝備站和青少年校外活動中心。

區教育局的主要職能是：全面貫徹黨和國家的教育方針、政策、法規和上級教育行政部門的指示，結合本區實際研究制定區教育事業的發展規劃和各項計劃、實施辦法和補充規定，并組織實施。 管理和指導本區基礎教育、職業技術教育、成人教育和特殊教育；會同有關部門管理、指導、協調各行業、各部門的教育工作。 規劃、協調指導各類學校的教學改革工作；負責指導開展教育科學研究和教學研究；指導我區教育綜合改革工作。 按照管理權限負責本區各類學校的開辦、撤銷和合并及其專業設置的審核或報批；統籌協調和指導社會力量辦學。 會同有關部門擬定籌措教育經費、教育撥款、教育基建投資政策；統籌安排全區教育費附加、教育專項經費；會同有關部門檢查、指導學校教育事業經費的使用情況；監督審計所屬單位的教育事業經費。 負責教育方針、政策、法規的宣傳工作；指導學校思想品德、體育、衛生、藝術和國防教育工作；負責高中畢業會考工作。規劃、指導教師隊伍建設工作；負責教育系統專業技術職務的評審工作；負責并指導學校內部管理體制改革。 指導各類學校教學設施、儀器、圖書資料的配備；指導管理本區教育系統的勤工儉學、校辦產業工作。負責教育事業統計調查，以及統計信息的管理與服務；指導教育學會、協會等社團組織工作；會同有關部門組織管理教育對外交流與合作。 負責教育局所屬單位黨組織的建設、管理工作；按照管理權限管理、使用、培訓、考察、任免、監督領導干部；負責對局系統黨員的培訓、教育和管理工作的指導。 負責教育局所屬單位黨的紀檢、行政監察工作；負責局系統統戰、離退休干部管理工作；負責局系統宣傳、思想政治和精神文明建設工作；負責局系統工會、共青團和婦女工作。負責區屬學校的穩定、安全保衛工作，協同有關部門處理突發事件。 受區政府委托，管理教育督導室。負責制定全區教育督導工作的規章和制度，監督、檢查、評估區級有關部門和各級各類學校對國家有關教育方針、政策及有關法律、法規的貫徹執行情況。負責語言文字和指導推廣普通話工作。承辦區政府交辦的其它工作任務。

孝南區教育局位于槐蔭大道238號。2014年秋季，共有中小學88所，其中高中4所、中職學校1所、初級中學16所、小學63所，公民辦幼兒園93所。