浙江大學環境工程研究所先后承擔了40多項國家863計劃重大課題（項目經費達2280萬元），國家自然科學基金重點項目（總經費160萬元）等國家級科研項目和省部級重大、重點、一般科研項目及多項超過100萬的橫向項目，近五年發表論文500余篇，其中SCI、EI論文近200篇。研究成果曾或全國科學大會獎，國家發明獎，國家科技進步獎及省部級獎勵16項。在大氣污染控制與治理、水污染控制與治理等研究方向上居國內水平。