南岸區交通運輸管理所成立于1997年，負責轄區內運輸市場管理，維護客貨運輸秩序，執行維修行業、維修行業及駕培行業的行政審批，發展公路運輸服務業。
內設辦公室、客貨運輸管理科、客貨運相關業務科、財務證牌科和安全服務質量監督科5個科室。