學校創建于1997年5月，是一所具有現代化辦學條件的市直屬中學。建校三年被破格評為“市一級學校”，建校四年被破格評為“省一級學校”，在我市率先建成校園網絡系統，成為東莞著名的示范性窗口學校、廣東省一百所中小學現代教育技術實驗學校之一、教育部“十五”重點課題體育新課程實驗學校、教育部社政司素質教育實驗基地。2004年8月，由原城市中心區校址搬遷到交通便利的五環路東城牛山路段。

新校由市政府投資1.76億元興建，占地面積175畝，建筑面積10.6萬平方米，校園由教學區、實驗功能區、生活區、體育運動區組成，設施和教學裝備按國家級示范性普通高中的標準規劃和建設：學校高起點建成了校園網、60個多媒體教室，有高標準的電視監控系統、公共廣播系統、有線電視系統及軟件制作室和多功能演播廳，有高標準的多功能體育館、游泳池、塑膠籃球場、排球場、網球場和具有國際標準400米10跑道塑膠田徑運動場等規模宏大的室內外體育設施，有高配置的藝術樓、實驗樓、圖書館，其中，藝術樓設有鋼琴房、合唱排練廳、舞蹈室、器樂排練室等，實驗樓除有14個標準實驗室外，還有高標準配置的6個探究實驗室，圖書館有近9萬冊豐富的藏書及2間電子閱覽室。今日的東莞高級中學，環境優美、設施齊全、設備，是一所花園式的現代化高級中學。

學校以“讓每一位學生健康成長，讓每一位家長放心滿意，讓每一個教師自由發展”為辦學指導思想，堅持依法管理、依法執教，堅持德智體全面發展的方針，堅持面向社會辦學的原則，八年來，形成了“嚴格管理，全面發展，低進高出”的鮮明辦學特色。，形成了優良的校風，保證了學生犯罪率為零，高考成績一年上一個新臺階。

學校提倡科研興校，大力實施教育教學改革，全面推進素質教育，取得了突出的教育教學成果。三年來，學校有45項成果獲得了國家和省級獎勵，語文、數學、英語、政治、物理等科組先后被教育局授予科組稱號，語文科組創立的作文教學法在全市各高中推廣，該科組因此獲得2004年市五一勞動獎章、被省總工會評為“模范職工小家”。學生在文藝、體育等各項競賽中多次獲得市級和省級獎勵，學校有眾多的學生在全國數學、物理、化學、生物競賽和省市作文競賽中獲獎，獲獎人數和檔次均列市前茅。學校高考連創佳績，上線人數、上線比例、重點入圍人數連年遞增，各項指數多次列全市**，提高幅度為全市之冠，為北大、人大、復旦等高校輸送了大批學生。學校多次被評為市文明單位、科教興市先進單位、三現代教育先進單位。學校以優良校風和突出成績受到全市各界人士的高度贊譽。

學校師生員工同舟共濟，爭取早日進入全國示范性高中行列，進一步健全和完善制度治校，讓“文化育人”成為學校新的辦學特色，借助新課程改革的東風，力爭較短的時間內在教育教學上尋求新的突破，不斷創造新的輝煌。將來學校必定認真貫徹國家的大政方針，響應的號召，在上級領導下，辦好內地新疆高中班，用實際行動支持西部建設，為國家實施民族政策做出應有的貢獻。