歷時(shí)三年，遷至倉前山太古坪（今倉山小學(xué)內(nèi)）。1873年買下外商經(jīng)營的“太茂茶行”作校舍，即現(xiàn)在的十六中校址（倉前山麥園路35號）。1909年改校名為“毓英女塾”，學(xué)校自創(chuàng)辦至此時(shí)都沒有固定的學(xué)制，以后學(xué)制定為8年制，再改校名為“毓英女子學(xué)校”，1927年向當(dāng)時(shí)的福建政務(wù)委員會(huì)申請立案，9月新學(xué)期開始時(shí)，正式定名為“福州私立毓英女子初級中學(xué)”這一校名一直沿用至1952年。

“毓英”自1859年創(chuàng)辦到1952年人民政府接辦，共93年歷史，畢業(yè)學(xué)生約1200人（平均每年畢業(yè)約13人）。“毓英”的辦學(xué)經(jīng)費(fèi)來源于衛(wèi)理公會(huì)，主理校政者均為美藉女傳教士。1927年“收回教育權(quán)”后，成立校董會(huì)，由校董會(huì)指派三人，組成三人小組主理校政，兩年后改為董事會(huì)下的校長制。

抗戰(zhàn)時(shí)期，“毓英”四度遷徙（遷往閩清、順昌），二度易名（改為衛(wèi)理公會(huì)所屬的“三聯(lián)中”）。

1952年7月，福州市人民政府接辦“福州毓英女子初級中學(xué)”，并將“福州私立尋珍女子初級中學(xué)”和“福州私立郵電學(xué)校”的女生并入，成立“福州第二女子中學(xué)”，由初級中學(xué)改為完全中學(xué)，學(xué)校性質(zhì)由私立轉(zhuǎn)變?yōu)楣ⅰ?/p>

1956年，“福州第二女子中學(xué)”改名為“福州第十六中學(xué)”，男女學(xué)生兼收，結(jié)束了女校歷史。