學校創辦于1956年，原名“南通市商業學校”，1978年更名為“江蘇省南通供銷學校”，隸屬于江蘇省供銷合作總社。2003年11月，學校升格為“江蘇省南通商貿高等職業學校”，同時增掛“江蘇聯合職業技術學院南通商貿分院”校牌，2013年1月，江蘇省政府同意在江蘇省南通商貿高等職業學校(江蘇聯合職業技術學院南通商貿分院)基礎上建立江蘇商貿職業學院，2013年5月，國家教育部通過了建立江蘇商貿職業學院的審核備案。
學院坐落在被譽為“中國近代**城”的江蘇省南通市，處于上海1小時經濟圈內，地處港閘區北翼新城核心地帶，交通便捷，區位優勢突出。目前，學校占地面積502畝，規劃總建筑面積32萬平方米，建有物流、商貿、計算機、會計、電子等五大實訓中心;開設經濟貿易、經濟管理、應用外語、信息技術、應用電子等5個專業大類，近二十個五年制高職專業和十余個三年制中職專業;在校學生7000余人。學校擁有一支“人員精干、結構合理、素質優良”的師資隊伍，現有教師340余人，外籍教師7名，其中副高以上職稱86人，講師116名，碩士以上學位74人，在讀博士、碩士研究生53人，特聘教授8人;畢業生就業率一直保持在98%以上，建校以來先后為社會輸送了近6萬名合格畢業生。
作為行業舉辦的省屬地方職業院校，近年來學校以“立足地方聚合地緣優勢，依托系統彰顯商貿特色”為辦學方向，積極順應南通經濟轉型升級的趨勢，主動融入系統(行業)發展行列，學校教育教學呈現了良好的發展態勢。學校先后獲得全國供銷合作社系統先進集體、江蘇省職業教育與社會教育先進單位、江蘇省德育工作先進單位、江蘇省文明校園、江蘇省平安校園等榮譽。2011年學校成為全國物流職業教育人才培養基地，2012年被認定為江蘇省首批職業教育技能教學研究基地。學校加入了“南通市高校服務地方聯盟”，進駐“南通高校技術成果轉移中心”，是江蘇報關人才培養聯盟南通地區唯一成員單位。
