南京百院教育研究所始建于2003年，其前身南京創新教育科學研究中心，是由高等教育工作者和高等教育機構聯合申請，經南京市科學技術委員會批準成立的區域性研究高等教育科學的民辦非企業單位。2006年5月22日經國家行政主管部門批準成立：南京百院教育發展研究所。研究所辦公地址設在江蘇省社會科學院。
南京百院教育發展研究所響應黨**、國務院關于擴大高等教育招生規模的決策及千方百計助學就業的方針,堅持高校畢業生就業制度的改革方向,聯袂百（萬）所高等教育機構共同打造中國教育陽光工程平臺；堅持走出去與請進來相結合、與研究人員相結合、理論研究與實踐創新想結合的原則；堅持以教育資源平衡研究為主，從事教育資源的研究、開發、推廣，提供教育信息咨詢、培訓服務；堅持以科學發展觀為統領，與時俱進，廣泛吸收國內外教育新研究成果，虛心向國內外典型學習，在自主的基礎上，開放合作式發展空間,啟用實用出色的運營模式以及技術特色，走研學產相結合的發展道路，推動了教育研究、教育資源平衡在教育服務業的狂飆發展。南京百院研究所現已形成以高、中等院校需求導向，以調查研究、開發優質教育資源和推廣教育項目為特色，集教育科研、信用助學、人才培養、產業研發為一體的綜合性、多功能的發展格局和生長形態。是國內首家關注中國教育資源平衡及高等教育招生政策變化的非官方教育研究機構。在新的發展時期，南京百院教育教育研究所正以高度的責任感、嶄新的姿態、扎實的研究，與時俱進，開拓創新，為中國教育資源平衡和建設創新型教育和和諧社會而迎接新的挑戰！
南京百院教育發展研究所通過研究機制改革創新、優化與完善，打造了一支勇于探索、銳意創新、充滿活力的團隊，現有專職人員26人，另外還聘請了一批兼職研究員。我們長期擁有一支近萬名在校大學生組成的高素質招生咨詢志愿者團隊，并聘請了眾多知名教授、高校招辦老師等組成的教育咨詢團。全所實行所長負責制。
百院宗旨：
以馬列主義、毛澤東思想、鄧小平理論和“三個代表”重要思想為根本方針，貫徹落實科學發展觀，貫徹黨和國家的教育方針和“百花齊放、百家爭鳴”方針，遵守憲法、法律、法規和國家政策，開展基礎教育、高等教育信用助學的理論與實際問題的研究，總結經驗，探索規律，為基礎教育、高等教育的改革與發展服務。倡導教育經紀，引導教育消費，服務現代教育，服務廣大求學者。

百院職能：
百院主要職能為基礎教育教學業務管理、高等教育科學發展研究、信用助學研究、高校畢業生就業指導： 一、高等教育科學研究、教育課題的開發、推廣；
二、高等教育形象設計策劃及開展教育文化經紀系列服務； 三、各類學歷提升；職業技能培訓、取證； 四、響應國家有關精神：探討開發公益事業、發展研究信用助學、落實下崗創業及社會再就業精神、為大學生勤工助學與社會實踐及社會再就業人員提供幫助；
五、上級主管機關賦予研究所其它社會職能。