我校的源頭為二十世紀50年代初期創辦的南京市上新河中學和80年代創辦的南京市南湖一中兩校的高中部。1995年，南京市區劃調整，上新河中學由雨花臺區劃歸建鄴區。翌年至2003年，區委區政府把南京市第五中學與上新河中學高中部整合，報市政府批準，上新河中學為江蘇省重點中學南京市第五中學的寄宿制高中分校。南湖一中于1985年創立，1988年設立高中部，2000年被評為市重點。2003年，其高中部遷至南苑。2004年，南京市又一次區劃調整時，第五中學劃出建鄴區；南湖一中高、初中剝離，成立南湖高級中學，原五中上新河分校成為其分校區。同年，被評為江蘇省三星級高中。05、06連續兩年被南京市教育局授予教學推進獎。

隨著南京市河西建鄴新城的蔚然崛起，迅猛發展，建鄴區委區政府為落實“科教興區”的戰略，開創河西教育高起點的新局面，實現建成“文化大區”的目標，對兩校高中部優質資源進一步整合，完全合并，報經市政府批準，于2007年4月18日正式揭牌命名為南京市建鄴高級中學。同年被評為江蘇省四星級高中。

追溯校史，半個多世紀的艱苦奮斗、敬業奉獻，張揚深厚的愛生情懷，春風化雨育芳菲；乘改革開放之春風，開拓進取，綻放富有生命力之花，不斷發展。兩校已為社會主義建設事業輸送了數以萬計的合格勞動者，其中拔乎其萃者，有分別在**部委、地方各級政府部門、軍隊、高校、文藝界等任職的，至今仍兢兢業業地在其崗位上為祖國貢獻力量。

看今朝，團結、務實、奮進的領導班子繼往開來，與時俱進，聚兩家“三風”建設之精粹，匯兩家辦學理念之底蘊，秉持“精粹精進，向善向上”的精神，以精細化的管理理念，全力創建“特色鮮明，質量”的精品高中。教師嚴謹治學，已形成“求真、求活、精益求精”的教風。建鄴高級中學正全力打造精品形象，譜寫精美華章，在新的征途上直掛云帆濟滄海，信心百倍地向著勝利的彼岸遠航。

58屆陳先安江蘇省監獄管理局副局長[1]

60屆斐德義，江蘇省音樂家協會副主席，國家一級演員

61屆成正和，中國作家協會會員，江蘇知名作家

63屆單泰裕南京輕型飛機股份有限公司副總經理

63屆吳冬華曾任無錫市市長、中共揚州市委書記、現任江蘇省政協副主席　　　　63屆肖奚安解放軍理工大學理學院數學系著名教授

73屆鐘沛南京市企業改革先行者，現任上海淮海商業（集團）有限公司總經理

73屆李吉平六合區區委副書記

70年代丁應通雨花臺區板橋新城副總指揮

74屆曾菱紅河海大學教授碩士生導師

74屆史先榮下關區區委常委副區長

76屆黃海華南京軍區空軍副大隊長，獲得飛行“銀質”獎章

80屆王俊明曾任中國注美國休斯敦總領事館副領事、中國注荷蘭大使館一等秘書現任國務院科技部人事司副司長

80屆錢趨程南京榮成化工有限公司總經理

84屆霍慧萍秦淮區區委常委副區長

84屆朱毅建鄴區法制辦公室主任

85屆劉蒞建鄴區委辦公室主任

96屆過玉賓現為江蘇舜天足球隊主力隊員

99屆丁培在校期間發明的“傘具抗風減壓裝置”獲全國發明、一等獎

章震宇現任職國家第十四研究所首席攝影師江蘇省美術家協會會員中國國畫家協會會員中國書畫研究院畫家南京市攝影家協會會員[2]