南通市教育局是主管全市教育事業(yè)的市政府工作部門，為正處級。與市委教育工作委員會合署辦公。

辦公室

綜合協(xié)調(diào)局機關(guān)重要政務(wù)、事務(wù)，負責全局會議及局長辦公會的準備工作，協(xié)助局領(lǐng)導(dǎo)督促對會議決定事項的組織實施，負責活動的安排；負責擬定年度工作計劃，撰寫年度工作報告，起草、審核重要文稿、文件；負責文件、電報、電傳的運轉(zhuǎn)和管理；負責重要調(diào)研工作的組織實施和重大工作任務(wù)的督辦；對各縣（市）、區(qū)、直屬單位對市政府和省教育廳的請示提出擬辦或處理意見，協(xié)助局領(lǐng)導(dǎo)處理有關(guān)重大事項和突發(fā)事件；負責文秘、信息、信訪、機要、檔案、外事、保密、保衛(wèi)、民調(diào)以及機關(guān)財務(wù)、資產(chǎn)管理工作；指導(dǎo)、協(xié)調(diào)全市教育系統(tǒng)綜合治理工作；負責人大代表建議和政協(xié)委員提案的辦理工作；負責局管單位的計劃生育工作；負責全市教育法治建設(shè)和普法工作；組織開展教育法治宣傳、培訓；受理教育行政投訴，承辦教育行政復(fù)議案件；參與組織教育行政執(zhí)法，督促檢查依法治教工作；協(xié)調(diào)與外省、外市等地區(qū)教育協(xié)作和對口交流支援工作。負責與各級新聞媒體溝通與聯(lián)系工作，做好報紙、電視、電臺等新聞媒體上的教育宣傳工作。

政治處、人事處

負責局機關(guān)和直屬單位黨的組織、宣傳、統(tǒng)戰(zhàn)、群團工作；指導(dǎo)協(xié)調(diào)大中專院校、中小學思想政治工作和精神文明建設(shè)；指導(dǎo)大中專院校和負責局直學校普法宣傳教育工作；配合市委組織部做好部管學校（單位）干部的考察管理工作；指導(dǎo)縣（市）區(qū)教育行政部門黨的建設(shè)和思想政治工作；負責局管干部的教育、培訓、考察、任免等工作；負責保管干部檔案、接轉(zhuǎn)黨組織關(guān)系、黨員統(tǒng)計、黨費收繳等黨的事務(wù)工作。 負責局機關(guān)直屬單位機構(gòu)編制、人事管理、勞動工資、保險、福利等工作；協(xié)調(diào)指導(dǎo)全市中小學機構(gòu)編制管理和人事制度改革工作，負責局機關(guān)、直屬單位人員的考核獎懲及全市中小學綜合性評估表彰；負責全市師范類畢業(yè)生就業(yè)、改派工作；負責局機關(guān)及局直單位的離退休干部管理和服務(wù)工作。

紀檢組、監(jiān)察室

負責貫徹落實關(guān)于加強黨風廉政建設(shè)和行政監(jiān)察工作的決定，檢查黨的路線、方針、政策、決議和國家法律法規(guī)政策在教育系統(tǒng)的執(zhí)行情況；負責檢查并處理教育系統(tǒng)黨組織和領(lǐng)導(dǎo)干部的違紀案件；受理監(jiān)察對象不服政紀處分的申訴，個人或單位對監(jiān)察對象違紀行為的檢舉、控告；負責推進教育行風建設(shè)，加強對招生、收費、職評、基建、大宗物資采購等方面的行政監(jiān)察；負責對教育系統(tǒng)的黨風廉政建設(shè)、紀檢工作及其政策問題進行調(diào)查研究，擬定有關(guān)政策規(guī)定，制定有關(guān)黨內(nèi)紀律的實施辦法；承辦局黨組、局長室授權(quán)和交辦的其他任務(wù)。