明清時期，南陽市區(qū)先后有8所書院，清末至抗日前夕，南陽市區(qū)有小學(xué)達(dá)200多所，中學(xué)10余所。南陽擁有八所高等學(xué)校、十四所中等專業(yè)學(xué)校，是中國農(nóng)科院、中國林科院的科技示范市。2000年3月，經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，南陽師專升格為南陽師范學(xué)院（河南文理學(xué)院），成為南陽歷史上**所省屬全日制本科高等學(xué)校。2004年6月，南陽理工學(xué)院升本成功，成為南陽市第二所本科院校。2005年河南佛教學(xué)院批準(zhǔn)成立，成為南陽市第三所本科院校。
2012年年末南陽市擁有研究生培養(yǎng)單位1個，擁有普通高等學(xué)校5所，成人高校1所。中等職業(yè)技術(shù)學(xué)校87所，普通高中71所，初中學(xué)校433所，普通小學(xué)3716所，特殊教育學(xué)校10所。