天臺山佛學院的前身是天臺山佛學研究社，1931年創立于國清寺，50年代停辦。1983年，黨的宗教政策落實后，研究社得到恢復，面向全省寺院招生。1999年，由于國清寺游人眾多，在慧岳法師的倡議下，經政府有關部門批準，研究社遷到智者塔院，并更名為天臺山佛學院。

佛學院的30多名學僧來自全國15個省市，全是10歲以上、30歲以下、出家1年以上的男僧，大部分高中畢業，也有多位大學生。他們除了學習以天臺宗為主的佛教知識，還要學習古代漢語、書法、英語(或日語)、電腦等課程，由7位法師和3位老師任教，其中2位是浙江師范大學的退休教授。