農學院現建有作物遺傳與種質創新國家重點實驗室、國家大豆改良中心和國家信息農業工程技術中心3個國家級平臺、8個省部級重點實驗室和5個工程中心。擁有作物學國家重點一級學科，以及2個國家級重點二級學科（作物遺傳育種學、作物栽培學與耕作學）、2個江蘇省重點交叉學科（農業信息學、生物信息學）。設有1個博士后流動站、8個博士專業、5個碩士專業、5個本科專業。設有明天獎學金、英才獎學金、寧粳獎學金和新紀元樹人獎學金等。
“十五”以來承擔國家“973”計劃、“863”計劃、國家科技支撐計劃、轉基因重大專項、農業部公益性行業專項、國家自然科學基金等國家及部省級科研課題和國際合作研究課題400多項，累計研究經費超過5億元。獲得國家科技進步一等獎1項，國家科技進步二等獎5項、部省級科技成果獎勵15項，獲國家發明專利58項、植物新品種保護權21個、軟件著作權67個，制定省頒標準46項，培育出大豆、小麥、棉花、水稻等省農作物新品種55個。
農學院大力拓展國際合作與學術交流領域，先后與美國、日本、英國、加拿大、荷蘭等國家的30余所大學和科研機構建立了長期的合作關系，同時還與美國康奈爾大學、伊利諾伊大學、俄勒岡州立大學、荷蘭瓦赫寧根大學、日本千葉大學等建立了本科生“2+2”聯合培養計劃。每年接待合作研究與交流人員達150人次以上。
2011年，學校確立了建設世界農業大學的宏偉目標，農學院將秉承“誠樸勤仁”的校訓，在人才培養、科學研究、社會服務、文化傳承上取得更大的成績，為我國農業現代化貢獻更大的力量。[1]
南京農業大學農學院是我國創立早的農學系科之一。在長達近百年的辦學歷史中，一大批新中國農業科技的奠基人和開拓者在該院任教，他們是：著名小麥育種家、中國科學院院士、前中國農業科學院院長金善寶教授，著名棉花、中國科學院院士馮澤芳教授，著名數量遺傳和大豆育種家、前南京農業大學大豆研究所所長馬育華教授等。此外，徐冠仁、莊巧生、蔡旭、鮑文奎、王綬、盧良恕、鄒秉文、過探先等一代著名院士和學者在該院曾就讀或工作，還培養了大批部省級領導、和教授，以及在農業戰線各層次尤其是基層勤懇工作，默默奉獻的社會主義建設者。經過幾代人的艱苦努力，農學院已經建立了完整、成熟、先進的人才培養體系，形成了誠樸、勤奮、實干、創新的優良學風，構筑了結構合理、精明強干、勇于創新的學術梯隊。
全院現有教職工155名，其中國工程院院士2名，長江學者特聘教授2名，教授32名，副教授38名，博士生導師37名，碩士生導師32名。中國工程院院士、著名小麥遺傳育種家劉大鈞教授，中國工程院院士、著名大豆遺傳育種家蓋鈞鎰教授，中國農業科學院院長、著名遺傳育種家翟虎渠教授現在本院任教。建院以來，農學院已累計培養博、碩研究生2000余人。本科生近萬人。
農學院擁有1個國家級重點實驗室（作物遺傳與種質創新國家重點實驗室）、1個國家研究中心（國家大豆改良中心）、3個省部級重點實驗室（教育部作物遺傳與特異種質創新重點開放實驗室、農業部作物生長調控重點開放實驗室、江蘇省信息農業高技術研究重點實驗室)、4個省部級研究中心（農業部小麥區域技術創新中心、國家水稻改良江蘇分中心、農業部轉基因大豆安全檢測和監測中心、江蘇省植物基因工程技術研究中心）和10個校級研究所和中心、2個國家級重點學科（作物遺傳育種、作物栽培學與耕作學）、1個農業部重點學科（作物學）、1個江蘇省重中之重學科（作物學）、2個江蘇省重點學科（農業信息學、生物信息學）。現有各類實驗室8000㎡、溫室800㎡、網室10000㎡、實驗地60多公頃，在校本科生人均實驗設備價值60000元以上。設有1個博士后流動站、9個博士專業、6個碩士專業、4個本科專業，招生培養多層次高級科技和管理人才。設有李揚漢獎助學金、黎懷德助學金、寧粳獎學金和新紀元樹人獎學金等，作為對品學兼優和特殊貧困生的獎勵資助。
農學院近年來承擔國家"863"計劃、"973"計劃、"攀登計劃"、國家攻關、國家自然科學基金、部省級科研課題和國際合作研究課題400多項，年均研究經費3000多萬元。科研經費充足，科研成果累累。十五期間先后獲得17項國家和部省級科技成果獎勵、14項國家發明專利，8項植物新品種保護權、26項軟件著作權，制定省頒標準43項，培育出28個大豆、小麥、棉花、水稻等省農作物新品種，出版專著、教材18部，發表學術論文872篇。農學院還與全國各行政事業、科研教學和企業單位建立了緊密的人才培養和就業協作基地。
院行政機構 ----院辦公室（行政辦公室、教學科研辦公室、研究生辦公室、本科生辦公室） ----農學系 ----遺傳育種系 ----種業科學系 ----農學試驗站
科研機構
國家級 ----作物遺傳與種質創新國家重點實驗室 ----國家大豆改良中心 ----國家農業信息工程技術中心
部級 ----教育部雜交棉創制工程研究中 ----教育部農作物特種遺傳資源標準化整理、整合及共享平臺 ----農業部大豆生物學與遺傳育種重點實驗室 ----農業部華東作物基因資源與種質創制重點實驗室 ----農業部長江中下游粳稻生物學與遺傳育種重點實驗室 ----農業部作物生理生態與生產管理重點實驗室 ----農業部小麥區域技術創新中心 ----農業部轉基因大豆檢測與監測中心（南方） ----農業部長江中下游轉基因水稻中試與產業化基地（共建）
省級 ----江蘇省信息農業高技術研究重點實驗室 ----江蘇省基因工程技術研究中心
校級 ----大豆研究所 ----棉花研究所 ----水稻研究所 ----細胞遺傳研究所 ----區域農業研究所 ----農業信息技術研究中心 ----作物生理生態研究所 ----應用生態研究所作物基因組與生物信息學研究中心 ----作物基因組與生物信息學研究中心[2]
農學院一貫注重國際合作與學術交流，先后與美國、日本、英國、加拿大、荷蘭、韓國等國家的20余所大學和科研機構建立了長期的合作。近五年來，先后合作研究與接待交流人員達200多人次。
培養具備植物生產與管理、植物遺傳育種等方面的基本理論、基本知識和基本技能，從事農業科學領域教學與科研等工作的學術研究型人才和復合應用型人才。
二、基本規格和素質要求
1．基本規格
具有良好的思想品德、社會公德和職業道德，具有寬厚的自然科學的基本知識和人文素養，熟練掌握農業生物科學、農業生態科學、植物生長發育和遺傳規律等農學類基本理論和基本知識，具備植物生產與管理、植物新品種選育等方面的基本技能和科研創新能力。
2．素質要求
（1）素質結構
1）具備良好的思想道德素質：包括正確的政治方向，遵紀守法、誠信為人，有較強的團隊意識和健全的人格。
2）具備良好的文化素質：掌握一定的人文社科基礎知識，具有較好的人文修養；有較好的外語能力，具有國際化視野和現代意識。
3）具備良好的專業素質：受到嚴格的科學思維訓練，掌握比較扎實的農學類基礎理論和先進的科學研究方法，具有求實創新的意識和精神。
4）具備良好的身心素質：包括健康的體魄、良好的心理素質和生活習慣。
（2）能力結構
1）學習的能力：具有良好的自主學習能力、有良好的語言表達與交流能力。
2）應用的能力：具有綜合運用所掌握的理論知識和技能、從事農學及其相關領域科學研究的能力；具有良好的計算機及信息技術應用能力。
3）創新的能力：具有較強的創造性思維能力、開展創新研究和科學探索的能力。
（3）知識結構
1）具備扎實的數學、物理、化學等基本理論知識；
2）掌握農學類學科的基本理論、基本知識；
3）具備植物生產與管理的基本技能和方法；
4）掌握科學研究與實踐工作的基本方法，了解農業生產和科學技術的科學前沿和發展趨勢；
5）掌握科技文獻檢索、資料查詢的基本方法，具有獲取知識、科學研究、信息處理和創新的基本能力。
三、培養特色
彈性學習年限，創新型拔尖人才培養
四、學制
農學強化班實行彈性學習年限，采用“3+X”形式，X為1年、3年或5年。即：本科學制4年，本、碩連讀學制6年，本、碩、博連讀學制8年（3+1：完成本科階段學習；3+3：完成本科、碩士研究生階段學習；3+5：完成本科、碩士、博士研究生階段學習）。
五、主干學科和主要課程
1．主干學科
農學、園藝、植物保護、農業資源與利用等。
2．主要課程
植物學、植物生理學、基礎微生物學、生物化學、遺傳學、生物統計與田間試驗、作物栽培學、作物育種學等。
六、學位授予
農學學位
培養具備作物生產、作物遺傳育種及種子生產與經營管理等方面的基本理論、基本知識和基本技能，能在農業及其它相關的部門或單位從事與農學有關的技術與設計、推廣與開發、經營與管理、教學與科研等工作的學術研究型人才和復合應用型人才。
二、基本規格和素質要求
1．基本規格
具有良好的思想品德、社會公德和職業道德，具有寬厚的人文社會科學和自然科學的基本知識，熟練掌握農業生物科學、農業生態科學、作物生長發育和遺傳規律等方面的基本理論和基本知識，受到作物生產和作物新品種選育等方面的基本訓練，具有作物育種、作物栽培與耕作、種子生產與檢驗等方面的基本能力。
2．素質要求
畢業生應獲得以下幾方面的知識和能力：
（1）具備扎實的數學、物理、化學等基本理論知識；
（2）掌握生物學科和農學學科的基本理論、基本知識；
（3）具備農業生產，特別是作物生產的技能和方法；
（4）具備農業可持續發展的意識和基本知識，了解農業生產及其科技前沿和發展趨勢；
（5）熟悉農業生產、農村工作的有關方針、政策和法規；
（6）掌握科技文獻檢索、資料查詢的基本方法，具有獲取知識，以及具有一定的科學研究、信息處理和創新的基本能力；
（7）有較強的調查研究與決策、組織與管理、口頭與文字表達能力。
三、培養特色
普適型、應用型、復合型人才培養。
四、學制
四年。
五、主干學科和主要課程
1．主干學科
作物學。
2．主要課程
植物學、植物生理學、基礎微生物學、基礎生物化學、遺傳學、生物統計與田間試驗、作物栽培學、作物育種學、種子學、耕作學等。
六、學位授予
農學學位
培養符合市場經濟和科技發展需要，德、智、體、美全面發展，掌握種子科學與工程技術等方面的基本理論、基本知識和基本技能，能在種子科學與工程技術的相關部門或單位從事教學與科研、技術與設計、推廣與開發、經營與管理等工作的學術研究型人才和復合應用型人才。
二、基本規格和素質要求
1．基本規格
具有良好的思想品德、社會公德和職業道德，具有寬厚的人文社會科學和自然科學的基礎知識，熟練掌握農業生物科學、種子生物學、種子生產、種子加工貯藏、種子質量檢驗、種子經營管理以及企業運作等方面的基本理論和基本知識，受到作物種子生產、種子加工、種子質量檢驗與產業化經營等方面的基本訓練，具有作物種子生產與檢驗、種子加工貯藏、產業化經營等方面的基本能力。
2．素質要求
畢業生應獲得以下幾方面的知識和能力：
（1）具備扎實的數學、物理、化學等基本理論知識；
（2）掌握生物學科和農學學科的基本理論、基本知識；
（3）具備種子科學技術與經營管理的基本理論與技能；
（4）熟悉種子產業管理的國內外政策和法規；
（5）掌握科技文獻檢索、資料查詢的基本方法，具有一定的科學研究和實際工作能力；
（6）有較強的調查研究與決策、組織與管理、口頭與文字表達能力，具有獲取知識、信息處理和創新的基本能力。
三、培養特色
適應中華民族的振興和江蘇基本實現社會主義現代化的需要，立足江蘇、依托華東、面向全國、開放辦學，強化本校專業特色和優勢，根據“寬口徑、厚基礎、高素質、廣適應、強能力”的人才培養要求，培養基礎理論扎實、創新精神和實踐能力強的種子專業高素質人才。
四、學制
四年。
五、主干學科和主要課程
1．主干學科
種子學。
2．主要課程
作物育種學、遺傳學、作物栽培學、植物生理學、種子生物學、植物學、種子生產原理與方法、種子加工與貯藏、種子檢驗技術、種子營銷學等。
六、學位授予
農學學士。
培養具備農業現代化管理和農村區域社會經濟發展管理方面的基本理論、基礎知識和基本技能，能在政府及其職能部門、農業企業、農業推廣管理部門等事業單位從事宏觀管理決策、發展規劃、項目設計、農業技術推廣、農村建設與發展、農業經營與管理、教學與科研等工作，具有創新精神和實踐能力，德、智、體、美全面發展的學術研究型人才和復合應用型人才。
二、基本規格和素質要求
1．基本規格
具有良好的思想品德、社會公德和職業道德，具有寬厚的人文社會科學和自然科學的基本知識，熟練掌握農業現代化管理和農村區域社會經濟發展管理方面的基本理論和基礎知識，受到農村社會經濟和自然資源環境條件調研，農業及農村區域發展規劃、項目設計、管理決策、評價分析等方面的基本訓練，具有從事農業和農村區域（社區）發展規劃、農業項目經營管理、農業資源綜合開發管理等方面的基本能力。
2．素質要求
畢業生應獲得以下幾方面的知識和能力：
（1）掌握現代農業生產管理、經營和農村區域協調發展的基本理論；
（2）掌握包括農業生產管理學、農業經濟學、農村社會發展學、農業生態學等方面的基礎知識；
（3）具有和諧、協調、可持續的科學發展理念，具備社會主義新農村建設、農業和農村發展戰略分析和規劃、農業項目設計和經營管理等方面的綜合技能；
（4）了解當代農業科學技術和經營管理的前沿動態和發展趨勢；
（5）熟悉國家有關農業、農民和農村問題的方針、政策和法規；
（6）掌握一定文獻檢索、資料查詢、社會調查的基本方法，具有較好的組織與管理、外語應用、口頭與文字表達能力和一定的農村發展研究和工作開拓能力。
三、培養特色
兼具宏觀發展規劃、中觀經營運作、微觀生產管理的應用型、復合型人才。
四、學制
四年。
五、主干學科和主要課程
1．主干學科
農學、農林經濟管理。
2．主要課程
作物學通論、園藝學通論、畜牧學通論、農業推廣學、宏觀經濟學、微觀經濟學、發展經濟學、技術經濟學、資源與環境經濟學、管理學原理、農村社會學、農業法律法規、區域農業可持續發展、農業生產管理與經營、農業區劃、農村發展規劃設計、投資項目分析等。
六、學位授予
管理學學士。
