始建于2004年。煙臺大學為解決學生住宿問題，在距煙臺大學北校南六公里處而建。南校位于煙臺港城東大街100號，對面就是煙臺國際博覽中心，西臨濱州醫學院煙臺校區和煙臺市體育公園，西北方向還有逛蕩河，環境較好。南校區內主要有學生第十餐廳，宿舍樓7、8、9、10號，以及煙臺大學工程實訓中心焊接和鑄造部。先前在此住宿的是大一男生女生和大二男生，其中大二女生在大一結束的時候就會搬到北校區。自2013年暑假結束以后，南校區的布局將發生重大改進，首先為了迎接更多的新生的到來，原先五個人的宿舍將會在原先的基礎上加床改造，變成六人間。而整體的學生結構會變成大一全體，大二男生，大二文科女生。

南北校之間有109路公交車，自2010年以來，新增23路、567路、51路公交車，出行越來越便捷，極大的方便了南校區的師生。煙臺大學南校站的乘車路線：17路。首站末站：火車站-煙臺大學南校。上行各站站名：火車站-港務局-口腔病醫院-煙臺日報社-朝陽街-煙臺山醫院-張裕博物館-虹口賓館-**海水浴場-濱海假日酒店-月亮灣-棧橋-金龍橋-海濱住宅小區-財會培訓中心-第二海水浴場-海天名人廣場-萊山區政府-萬光觀海花園(遲家)-英杰學校-石溝屯-金海岸花園-黃海城市花園-山東工商學院-清泉寨-煙臺大學-煙臺大學南門-煙臺清泉學校-體育公園-孫家灘-濱州醫學院-煙臺大學南校下行各站站名：煙臺大學南校-濱州醫學院-孫家灘-體育公園-煙臺清泉學校-煙臺大學南門-煙臺大學-清泉寨-山東工商學院-黃海城市花園-金海岸花園-石溝屯-英杰學校-萬光觀海花園(遲家)-萊山區政府-海天名人廣場-第二海水浴場-財會培訓中心-海濱住宅小區-金龍橋-棧橋-月亮灣-濱海假日酒店-**海水浴場-虹口賓館-張裕博物館-煙臺山醫院-朝陽街-煙臺日報社-口腔病醫院-港務局-火車站

煙臺市特意增加的學生公交線路109路，路線為：煙臺大學文經學院---煙臺大學南校---煙臺大學南門---煙臺大學西門。票價五角，行駛時間大約為10分鐘。