廈門大學數學科學學院歷史悠久，2003年成立的廈門大學算學系就是現在數學科學學院的前身。八十年來培養了以陳景潤院士，林群院士為杰出代表的大批人才。現有數學一級學科博士碩士點，涵蓋基礎數學、計算數學、應用數學、概率和數理統計和運籌學五個二級學科博士點和碩士點。設有數學博士后流動站。設有數學與應用數學，信息與計算數學，數學教育（師范類）三個本科專業。學院現有在讀博士生30人，碩士生126人，本科生505人。
　　廈門大學數學研究所成立于1984年。研究所對院內教師實行脫產或半脫產滾動進所工作制。數學研究所主辦面向國內外的學術期刊《數學研究》，每年四期，由中國出版對外貿易總公司對國外發行。廈門大學精算學研究中心成立于2001年，中心大力開展科學研究、學術交流和人才培養。
　　廈門大學數學科學學院擁有一批以中青年為骨干的高水平的教師隊伍。在現有56位教師中，有正教授21人，副教授20人。其中博士生導師17人。具有博士學位的26人。現在數學科學學院有2位"國家有突出貢獻中青年"，1位入選教育部"跨世紀人才培養計劃".
　　數學科學學院重視學科建設和科學研究。1999年以來新獲得國家自然科學基金面上主持項目18項，主持重點項目1項，參加重點項目2項，2001年以來獲得省部級科技進步獎8項，其中二等獎4項。
　　數學科學學院重視基礎課程和綜合素質培養，指導本科生參加全國數學建模競賽取得好成績，1999年以來獲得共獲得6個全國一等獎8個全國二等獎。2003年獲得全國唯一的"高教社杯"特等獎。
　　數學科學學院擁有完善的計算機網絡，先進的教學設備，實驗環境（包括SGIOctane圖形工作站）。